肛瘘不能自愈，必须手术治疗。首先，时间长了容易癌变。其次，没有癌变者，增加肉体和精神上的痛苦，如肛门会经常疼痛，内裤是经常被脓血污染的，尤其是局部皮肤瘙痒，令人难以忍受。使体质下降，抗病能力下降。经常流脓血会导致贫血，感到很虚弱、没力气，精神萎靡等。所以，肛瘘对人的危害是很大的，及早手术治疗是上策。
肛瘘一般指瘘管分支数量多或外部开口复杂，在一个内部开口中有多个分支，甚至延伸到盆腔内形成复杂肛瘘的肛瘘。一旦发现，都需要尽快手术切除，因为随着时间的推移，它会导致越来越多的瘘管甚至严重的局部感染。
有高位复杂性的肛瘘，需要通过手术的办法进行治疗，位置越高越复杂的肛瘘，相对来说恢复的就越慢。还是要及早的进行检查和治疗，要避免大便干燥的情况。平时应该清淡饮食，避免辛辣刺激食物。
复杂性肛瘘由单纯肛瘘转变而来。它主要见于年轻人和中年人。起初，它是由急性肛周脓肿引起的，但没有得到有效的治疗。因此，肛瘘诊断后应及时手术。通常需要拉丝疗法。此外，术后应定期换药。排便规则必须保持畅通无阻，以避免污染。
自宫内膜增生是指子宫内膜长期受雌激素的刺激发生在子宫内膜的一组增生性病变，大多数为良性增生，仅少数可以缓慢发展为癌。子宫内膜增生经药物治疗后，内膜病变转轻或恢复正常，但停药后或产后仍有复发的可能，这种复发和人体的雌激素水平有关。服药期间要定期进行复查，如果有癌变倾向应该积极进行手术。也与情绪关系很大，所以要保持情绪乐观，避免长期抑郁。
