甲状腺囊肿是发生在甲状腺组织的液体囊性肿瘤，若甲状腺囊肿较小，患者可无任何症状处理的较大，如2-6cm，有压迫症状，外观明显肿块，需治疗。
甲状腺囊肿主要治疗手术，结节小时可穿刺吸出液体，注入无水酒精，或进行射频治疗、消融治疗。大多数患者需用手术治疗，尤其是大囊肿。甲状腺囊肿一般不会自行消退，有时略有缩小，里面的液体可以自行吸收，少数变小，但不能完全消除。患者在治疗上主要治疗手术，尤其是合并暴发性增大病史或合并囊内出血的患者需治疗手术。
不是所有甲状腺囊肿都需要治疗，而是要根据甲状腺囊肿的大小和形态而定。
一般甲状腺囊肿的诊断主要通过超声，即颈部彩色多普勒明确诊断。微小囊肿如3-4mm囊肿，无需进一步治疗，只需临床观察，无内分泌影响，无压迫局部胀痛的情况下只需每半年或一年进行颈部彩色多普勒，观察囊肿是否变大即可。对于较大囊肿，如给患者带来局部不适及压迫感，则需切除手术。如果确认为良性甲状腺囊肿，可以进行局部切除。而如果确诊为恶性甲状腺囊肿，则需要进行根治性甲状腺切除手术。
甲状腺囊肿一般不可以自愈。
甲状腺囊肿能不能自行愈合，要看其有没有多发性，结节的尺寸，结节边缘有没有钙化。甲状腺囊肿也就是所谓的囊性结节，它主要是由于甲状腺肿结节或者腺瘤的退行性变性而形成，里面包含着血液或者是微混液体，与周边界限清晰，质地比较坚硬，没有任何压迫感，核素检查提示为冷结节。少部分病例是由先天性的舌骨或第四鳃裂症所引起。对于甲状腺囊性结节，要考虑有没有多发性，有没有肿块，有没有钙化，如果有囊性结节，可以进行定期的检查，一般不会自己消退。
诊断甲状腺囊肿，检查甲状腺素的水平。如果甲状腺素增高，说明有可能是恶性的肿瘤。如甲状腺素不高等，则无需处理，勤查一查即可。甲状腺囊肿是一种良性疾病，在一般情况下不会引起症状，但是一旦发生，就要注意及时治疗，否则会造成严重后果。如甲状腺素的变化，论证问题比较严重，手术切除治疗势在必行。饮食上注意清淡、多油少盐。
此外，甲状腺囊肿的病人应保持平时的心理状态，乐观和愉快的心态，缓解种种压力。培养良好饮食习惯，食用新鲜水果及海产品。
甲状腺囊肿能吃海鲜。甲状腺疾病的种类比较多，甲状腺炎，甲状腺功能减退，单纯性甲状腺肿都可以吃海鲜。尤其是单纯性甲状腺肿，多和缺碘有关，而海鲜属于富含碘的食品，适量多吃点有助于改善病情。
甲状腺囊肿治疗主要依据甲状腺囊肿的肿物多少、大小来决定。较小甲状腺囊肿无需治疗，较大甲状腺囊肿或者短期内迅速增大的甲状腺囊肿。由于甲状腺囊肿多数是良性，手术切除之后，一般无需再进行其它方面的治疗。但是如果甲状腺囊肿较多，甲状腺组织也进行了部分切除，可能造成一部分病人甲状腺功能减低，术后还需配合进行甲状腺激素的治疗。
