衣原体感染后，患者可以在医生的指导下吃红霉素、罗红霉素、多西环素、米诺环素、阿奇霉素、克拉霉素等，这些抗生素对支原体和衣原体都是有效的。
不推荐使用头孢菌素、喹诺酮类的抗感染药物，这些药物对支原体、衣原体的治疗效果都不是很好。支原体、衣原体感染需要服用7-10天的药物来治疗。
衣原体感染用大环内酯类的抗生素好。
衣原体感染肺炎，可以服用大环内酯的药物，常用的药物有红霉素、阿奇霉素、罗红霉素等。患者可以根据医生的建议服用，一般服用2周以上，可以减轻感冒，防止呼吸道感染。另外，患者在平时应注意个人卫生，避免不洁的性生活。
衣原体感染用红霉素类、四环素类消炎药。
衣原体感染病人可应用红霉素，罗红霉素和阿奇霉素等红霉素类药物，疗效较好。还有四环素类药物，如四环素，盐酸米诺环素疗效亦较理想。如疗效欠佳，可选用喹诺酮类药物，例如莫西沙星，具有抗菌谱广，组织穿透力强。
但是以上药物都需要在医生的指导下使用。
衣原体感染可以通过外用药物治疗，如克拉霉素。
大环内酯类抗生素是治疗衣原体感染的常用药物，克拉霉素、阿奇霉素、强力霉素、交沙霉素等。如果口服药物治疗效果不理想，可以选择输液治疗。
妇科衣原体感染不仅需要口服药物治疗，还要注意局部清洁卫生，穿宽松的棉质软内衣。
通常情况下，导致衣原体感染的原因有间接感染、母婴感染、性接触感染等。具体分析如下：
1、间接感染：自身的免疫力比较低，在人群中接触到衣原体，就容易造成感染。
2、母婴感染：如果母亲本身有衣原体感染，在生产过程中，或者是在哺乳的过程中，就会造成婴儿出现衣原体感染。
