脑部ct能观察脑内出血，梗塞，肿瘤，骨折，尤其是颅内的钙化。脑部核磁共振对早期脑梗塞观察比脑部ct要早。对于脑部病变，脑部核磁共振优于脑部ct。脑部核磁共振不用打造影剂，可以进行脑血管成像，对脑内神经病变显示比ct更清楚，更明确。而且核磁共振没有辐射损伤，这一点明显优于ct。因此脑部疾病检查尽量选择核磁共振。
脑部核磁共振没有电离辐射，对人体没有放射性的损害。其中脑部核磁共振是利用人体内氢质子，在磁场中产生共振信号来获得的图像。脑部的核磁共振对颅内的检查能够更精确，同时脑部核磁检查不会出现颅骨的伪影，也不需要造影剂，就能够清楚的显示头部冠状位、矢状位等图像。
脑部核磁共振检查没有明确的副作用，因为基本原理是探测人体组织内蕴藏量最丰富的氢离子，在磁共振过程中发出电磁波信号测出氢离子浓度及其驰豫时间，作为成像的参数。
脑部核磁共振不能查脑供血不足，可以通过脑部核磁共振观察颅内血管走形及各级分支，观察血管有无畸形，有无狭窄，闭塞等。脑供血不足，需做个脑血管造影才能明确的。
每个地区的收费都是不一样的，头部ct大概2百-4百元，头部核磁共振7百-1千元。核磁共振几乎适用于全身各系统的不同疾病，如肿瘤、炎症、创伤、退行性病变以及各种先天性疾病的检查，注意劳逸结合，放松心情，饮食清淡，避免吃辛辣油腻刺激性食物。保持好心情。
费用约在1000元-2000元左右。在临床上头颅磁共振检查主要分为磁共振平扫、脑功能成像以及脑血管成像检查，其中磁共振平扫主要针对既往存在的脑血管病变，以及颅内占位性病变进行检查。
