注射乙肝疫苗后，人体免疫系统会对疫苗中的蛋白质抗原产生反应，一般在注射疫苗后大约一个月左右就会产生抗体，刚开始抗体水平很低，到了第二针，抗体水平就会迅速上升，很快就能抵抗乙肝病毒感染。接种乙肝疫苗后，从理论分析半个月后会逐渐产生抗体。不过早期抗体的浓度比较低，接种三针结束后，90%以上的患者都会出现保护性抗体。
注射乙肝疫苗后通常会产生抗体。
一般来说，注射乙肝疫苗后，大多数人都会产生乙肝抗体，但还是有少部分人会产生抗体，这可能与身体对乙肝疫苗的反应弱有关，或者本身就感染了乙肝病毒。乙肝病毒携带者表面抗原呈阴性。乙肝病毒携带者打疫苗时不会产生抗体，所以要定期检测乙肝病毒DNA。如果病毒呈阴性，可以考虑打加强针加强乙肝疫苗的刺激，看是否会产生表面抗体。
没有产生抗体的人群，仍需要每年继续打乙肝疫苗加强针，直至抗体产生。乙肝疫苗全程接种后，仍有4%的人群不会产生抗体。这与人体免疫系统有关，也与疫苗的效价、接种的时间和疫苗是否冷链全程有关。
乙肝疫苗在注射第一针后，30%的人产生表面抗体，第二针后50到70%的人产生表面抗体，第三针90%的人产生表面抗体。在全程注射完乙肝疫苗一个月后，应再次检测乙肝表面抗体产生抗体。
打了乙肝疫苗之后，如果身体内没有产生抗体这种症状。有可能是因为疫苗接种的剂量不足或者是和疫苗的质量及家族遗传因素有关系，一般症状下如果父母接种疫苗后不产生抗体，那么子女也会有这种现象发生。这种症状也不排除有乙肝病毒感染的可能性，需要做进一步的检查来确定。
注射乙肝疫苗之后身体内没有产生乙肝表面抗体，可能与自身的身体体质有关系，就没有必要再注射乙肝疫苗，但是需要注意避免输血，共用针头等，就可以避免乙肝病毒的感染，一般的日常生活乙肝病毒是不会传染的，也可以监测乙肝五项，或者是身体基因有没有明显的异常的情况。
