新生儿促甲状腺激素偏高的治疗方法，主要是根据甲状腺激素的水平进行选择。
1.若新生儿的促甲状腺素仅有轻微升高，则只要进行常规的检查，不需特别治疗，大部分情况下都能在一定程度上痊愈。
2.若新生儿的促甲状腺激素偏高，持续做了多项检测，出现了高的甲状腺激素，并且出现了持续不退、拒乳、嗜睡等症状时，可以口服左甲状腺素钠片、碘塞罗宁钠等。通过药物的处理，儿童的病情可以得到很好的改善。
新生儿促甲状腺激素水平在新生儿筛查项目中用于筛查先天性甲状腺功能低下。
如果宝宝的促甲状腺激素升高，怀疑先天性甲状腺功能下降，需要重新检查促甲状腺激素和甲状腺激素的水平。如果仍然偏高，甲状腺激素低于正常，则表现为甲状腺功能下降，需要立即开始甲状腺激素替代治疗，定期复查调整药物剂量。可能是先天性甲状腺功能下降，也可能是甲状腺功能暂时下降。甲状腺激素水平正常，促甲状腺激素稍高，无甲状腺功能减退症状，不治疗，定期复查，甲状腺功能成熟后促甲状腺激素可正常降低。这在早产新生儿中很常见。
甲状腺刺激激素高的儿童应定期就诊。如果甲状腺激素只高一次，一个月后可以复查。复查后连续2次偏高，一次高于一次，可采用优甲乐治疗。另外，对于单纯TSH高的儿童，不仅要复查，还要检查甲状腺激素5项。
病理性时比较麻烦，需超声查明原因，进行处理，尽早到甲状腺专科或普外科评估后进行控制和治疗。病理上，以药物治疗为主，尤其每月复查甲功八项，根据结果积极支持治疗。同时，治疗期间加强营养，定期复查即可。
每一个活产新生儿，生后3天，均需要采足底血进行新生儿疾病筛查。新生儿疾病筛查四种疾病，其中有一项是筛查先天性甲状腺功能低下，指标为TSH。新生儿TSH正常范围小于6个单位，6-10单位之间可以观察，大于10个单位（尤其是大于15个单位），需尽早干预并完善甲状腺B超及抗甲状腺球蛋白抗体等。
新生儿促甲状腺激素正常范围为0.56~5.91，新生儿促甲状腺激素数值非常重要。
出生后用足跟血筛查甲状腺功能，可初步发现甲状腺功能减退症如果怀疑新生儿甲减，建议常规医院儿科或内分泌科采血检测甲状腺功能5项，可进一步明确。新生儿促甲状腺激素超过5.91时，考虑甲状腺功能减退症的存在，建议口服哌甲酯，使甲状腺功能控制在正常范围。
新生儿甲状腺功能异常发生后，应选择甲状腺激素片进行补充和替代治。
但治疗前，最好先熟悉新生儿甲状腺功能衰竭是甲状腺功能减退，还是甲状腺功能亢进。甲状腺功能减退时，机体代谢速度过慢，出现粘液水肿，心率减慢，影响患儿智力。因此，及时补充甲状腺激素，抑制甲状腺功能变化至关重要。部分患儿需要长期用药，此时对长期用药，有基本用药标准。