乙脑疫苗包括乙脑减毒活疫苗和乙脑灭活疫苗两种，两种疫苗的接种时间是有区别的。首先是乙脑灭活疫苗是国家规定基础免疫共注射两针，出生后满6个月的婴儿，开始接种第一针，7到10天后接种第二针，一岁半到两岁左右，以及四岁的时候，各加强一针，六岁的时候再加强一针。其次是乙脑减毒活疫苗是1岁的时候接种第一针，2岁时加强免疫一针，7岁时再加强免疫一针。
乙脑疫苗比较安全，仅有少数小儿会出现不良反应。注射乙脑疫苗后可出现发热，还可出现头痛、头晕、乏力、寒战等全身症状，也可出现腹痛、腹泻、呕吐等胃肠道症状，一般在1天内可自然消退。注射乙肝疫苗后还可出现局部不良反应，如注射部位发红、肿胀、出现疼痛、皮温升高等，局部的不良反应一般持续数个小时。
乙脑疫苗分为灭活疫苗和减毒活疫苗两类。灭活疫苗，少数人可能出现一过性发热反应，也可出现红肿或皮疹现象，但大多症状较轻不需特殊处理，两天内可自行缓解，对个别出现严重过敏反应的，应及时采取针对措施。减毒活疫苗注射后一般无反应，少数人局部红肿，偶有发热或过敏性皮疹，一般不需特殊处理。
乙脑疫苗是预防流行性乙型脑炎的有效措施，对于乙脑疫苗注射以后出现的一些不良反应，如全身性的，发烧37—38摄氏度中间，伴随有腹泻，腹疼等，另外如果出现了反复注射的话不良反应的概率会高一点，所以注射以后要观察宝宝的反应，发现异常要及时就医。
宝宝注射乙脑疫苗以后，大部分会出现低烧，如果体温在38度左右，可以用温水擦浴的办法进行降温。如果体温较高超过38.5度以上，就需要考虑服药退烧，发烧期间还需要观察孩子是否有咽喉红肿，口干舌燥等。
