三碘甲状腺原氨酸偏低的原因可能是以下几点:
1.放射线：包括医源性外放射线接触、医源性内放射线接触、核爆炸后以及放射性碘的过量摄入。
2.低碘：低碘饮食可以导致三碘甲状腺原氨酸偏低的发生，其机制可能是缺碘导致甲状腺激素的合成以及分泌降低，反馈性的引起垂体分泌释放过量的TSH，致使甲状腺长期受过量TSH刺激，从而造成三碘甲状腺原氨酸偏低。
3.遗传因素：三碘甲状腺原氨酸偏低伴有家族遗传。
游离三碘甲状腺原氨酸低有以下三种原因：
一、甲状腺功能减退，甲状腺在工厂合成甲状腺激素。甲状腺激素有助于调节新陈代谢，促进生长发育，但甲状腺激素合成减少，游离的三碘甲状腺原氨酸可能会降低。
二、严重代谢疾病，甚至感染、创伤、手术，甚至严重抑郁焦虑等严重压力下，会发生代偿性代谢减慢，由总T4转化为T3。游离T3水平轻度下降，是这种生物保护性调节反应，无需治疗。
三、垂体功能减退，由于促肾甲状腺激素分泌减少，甲状腺功能减退，这被称为继发性甲状腺功能低下。
甲状腺功能减退症，三碘甲状腺原氨酸也就是实验室检查结果中的T3，这种物质主要从甲状腺中释放出来，如果含量偏低，则表示甲状腺本身分泌激素能量不足，容易出现甲状腺功能减退症。除此之外也应该结合TSH、T4进行综合性诊查判断。
甲状腺功能减退或甲状腺其余病变时三碘甲状腺原氨酸会减低。
甲状腺是人体最大的内分泌腺体，分泌的主要活性物质为四碘甲状腺原氨酸和三碘甲状腺原氨酸，对蛋白质合成、体温调节、能量产生和调节具有极其重要的作用。血清中的三碘甲状腺原氨酸大多由外周组织脱碘化而成，少部分由甲状腺直接分泌释放到血液中。三碘甲状腺原氨酸是甲状腺功能检测指标之一，通常与其余甜瓜指标同步变化，不仅是这一异常。
游离三碘甲状腺原氨酸是由甲状腺分泌，能与甲状腺分泌的四碘甲状腺原氨酸，共同促进蛋白质的合成、促进能量的产生、促进身体的基础代谢、调节体温的一种活性物质。游离三碘甲状腺原氨酸可直接通过甲状腺分泌释放到血液中，并与血红蛋白相结合产生生物反应，人体中的游离三碘甲状腺原氨酸能够准确的反应甲状腺的功能，对于甲亢、甲减等疾病的诊断具有重要指导意义。游离T3在临床上可以反映甲状腺的功能状态，特别是在甲亢的时候有非常重要的意义，能对甲亢状态起诊断作用。对甲状腺功能状态的敏感性和特异性都有比较高，在甲亢跟甲减治疗后期，同样是非常重要的监测指标。
偏低提示有甲状腺功能减退，需要进一步做甲功七项和甲状腺彩超来判断原因，.如果没有做过碘131治疗和甲状腺手术，甲状腺功能减退多和慢性甲状腺炎有关。因为可以产生和分泌甲状腺素的细胞减少，就会出现这种改变，可以同时伴有促甲状腺素的升高。
