主要的区别就是肛周脓肿，需要进行治疗好的手术，也就是需要处理原发感染灶。肛周脓肿和皮下脓肿都是有感染形成，并且创面下面都有脓液的情况，但是肛周脓肿主要还是由于肛窦感染引起来的，也就是说肛周脓肿的原发感染灶在肛门里面。
肛周脓肿术后饮食根据肠胃肠道内环境来调控，不需要早期就控制饮食，建议做完手术后，恢复到正常饮食即可，比如可正常吃点米饭、蔬菜、肉食。早期时可适当控制，注意清淡饮食，海鲜、海产品、菌类，以及容易引起肠道不适的食物要适当控制，一般不需要对饮食有太强要求。
肛周脓肿形成的原因多数是由于肛窦炎感染未得到及时控制，而波及到肛门直肠周围软组织，从而形成局限性脓肿。肛窦一旦感染后，会引起肛门腺感染化脓，炎症向肛周间隙内扩散形成肛周脓肿。
心率加快和下腹部疼痛、急性腹痛，同时伴阴道分泌物增多，子宫异常出血。盆腔检查有明显下腹部压痛和宫颈举痛，子宫和双附件区亦触痛剧烈，由于触痛拒按，双合诊多不满意。症状持续恶化，出现弛张型高热，腹膜刺激征更加明显，出现直肠压迫感、排便感及排尿痛等直肠和膀胱刺激症状，并有全身中毒症状。
常见的肛门周围皮肤下是有很多脓肿的，大多数都是因为肛腺被细菌感染后经外括约肌皮下部向外或直接向外扩散而成的，婴儿的肛门周围脓肿经常位于肛门周围皮肤下部，脓肿一般大小不是很大。
肛门囊肿和肛门脓肿主要区别是否有细菌感染。肛周囊肿是肛周皮脂腺分泌的皮脂淤积潴留，在局部形成囊肿（也叫粉瘤）。肛周脓肿是化脓性细菌感染了肛门腺，在早期没能控制住炎症，到中期感染就蔓延至肛门直肠的不同间隙并化脓形成了脓肿。
