新生儿接种乙肝疫苗需要在第一天接种第一针，第二针在30天内打第二针，180天打第三针。
现在普遍认为三次乙肝疫苗能够促进人体的免疫，从而降低乙肝病毒的感染几率，降低母亲的垂直传播的危险。不过，接种了乙型肝炎疫苗并不意味着就能得到保护的抗体，而保护性抗体的生成与自身的免疫力有关，因此需要在一周岁左右做一次血液检测，检测到乙肝两对半，以确定是否得到了保护的抗体，如果乙肝表面抗体为阴性则需要进一步接种。
结果表明，单用HBV抗体为阴性的儿童，不能有效地防止其它儿童的横向传染，只能通过普通接种来达到良好的预防作用。接种乙肝病毒的免疫覆盖率和免疫覆盖率是成正比的，接种范围和比率都会提高。
所以，开展乙肝疫苗免疫是减少乙肝感染的最好方法，同时也是防止乙肝感染的最佳途径。结果表明，要实现团体免疫，需要95%的接种覆盖率，才能实现目标的70.8%，而75%的接种覆盖率只有57.3%，低于75%的接种比例就会降低。
新生儿出生24小时内接种乙肝疫苗，常规的乙肝疫苗注射是016方案。
新生儿在出生24小时之内，要及时的接种第1针乙肝疫苗。如果出生24小时之后这种乙肝疫苗会影响到疫苗的预防效果。一个月和六个月的时候分别再注射后面的两针。若母亲是乙肝感染者，出生婴幼儿是低产儿、低体重儿在出生后更要加强一针，需分别在0、1、2、6个月注射乙肝疫苗。
乙肝疫苗加强针需不需要打，关键是看乙肝五项的检测结果。乙肝表面抗体是一项保护性抗体，作用在于保护机体免受乙肝的感染。因此如果没有乙肝表面抗体的人群或者也没有感染乙肝的人群，一定要打乙肝疫苗，这样是为了保护自己免受乙肝的侵犯。
一般情况下，新生儿黄疸通常不能打乙肝疫苗。具体分析如下：
新生儿在出生后的第一个月和六个月内打乙肝疫苗。如果新生儿满月30天，预防接种时会帮新生儿进行黄疸的检测。如果肉眼可见发黄，就不能打乙肝疫苗，需要查明病因。如果出现了轻微的黄疸，需要去医院做检查。新生儿需要在黄疸消失后，肝脏功能恢复，没有其他病理性的黄疸时，方可打乙肝疫苗。
新生儿接种乙肝疫苗的时间为出生后24小时内接种第一次，然后分别在1月龄、6月龄的时候再次接种，共3次。乙肝疫苗接种同样有一定的禁忌证，如携带乙肝病毒、对疫苗的成分过敏、患有神经系统疾病、重度营养不良、先天性免疫功能缺陷、正在使用免疫抑制剂等人群禁止接种乙肝疫苗。
