个别的患者在服用以后可能会有咽部不适。另外有些患者在空腹状态下服用可能会导致胃肠道的症状，出现腹胀、消化不良、烧心、反酸、恶心、呕吐，严重的有可能会导致腹痛、腹泻，个别的有可能会产生过敏反应，局部发红，然后皮肤瘙痒、皮疹等。
是由冬虫夏草发酵的菌粉制成，具有补肺肾，益精气，止咳化痰的作用。临床研究发现，百令胶囊具有双向免疫调节作用，能够抑制排斥反应和抑制细胞的凋亡。可用于肾脏疾病，比如治疗慢性肾衰，肾移植等，以及肝脏疾病，呼吸系统疾病如哮喘，难治性肺结核等，都有显著的治疗效果。目前对百令胶囊的副作用没看到临床报道。
百令胶囊主要成分为虫草制剂，主要适用于补益肺肾，可以适用于慢性的肾功能不全、慢性支气管炎等疾病，包括器官的排异反应等。临床中可以根据症状、体征以及整体病情评估选择用药。
百令胶囊用药比较安全，很少出现副作用，个别有可能出现胃肠道反应，尤其是空腹状态下服用，有可能引发恶性、消化不良的症状，比较罕见的有可能出现过敏症状，服药过程中药忌烟酒及辛辣、油腻食物。有高血压、心脏病、糖尿病等慢性病严重者，应在指导下服用。
百令胶囊是一种中药，没有直接起到减少肌酐的作用。百令胶囊是冬虫夏草制剂，具有保护肾脏，降低尿蛋白，降肌酐的作用，但是它降低肌酐的作用比较弱。百令胶囊起到缓解肾功能异常，修复部分肾功能的作用，主要是滋补作用。
