宝宝要在出生24小时内立即注射乙肝疫苗，然后是一个月和出生半年时，一共三针。如果乙肝妈妈的孩子要在出生当天注射乙肝疫苗及乙肝免疫球蛋白，阻断乙肝感染，再一个月及六个月后注射乙肝疫苗。
新生儿在出生后要打的是卡介苗和乙型肝炎，在生后三日就要进行皮下注射。
如有皮肤的病变、发烧等早产儿，可以暂时停止使用卡介苗，因为有可能存在先天免疫障碍的婴儿不能打卡介苗，以免引起身体的全面感染。在出生24小时以内注射乙型肝炎，第二、三次注射分别为1-6个月。如果母亲是乙肝病毒携带者，那么孩子出生后6个小时内要注射100个单位的高质量的乙肝免疫球蛋白，还要打乙肝疫苗。
新生儿需出生24小时内立即注射乙肝疫苗，然后是一个月和出生半年时，一共三针。如果乙肝妈妈的孩子需在出生当天注射乙肝疫苗及乙肝免疫球蛋白，阻断乙肝感染，再一个月及六个月后注射乙肝疫苗。有部分人群注射乙肝疫苗后，不产生抗体，可加大单次注射乙肝疫苗的计量，促进保护性抗体的产生。如果表面抗体为弱阳性，可注射一次乙肝疫苗加强治疗，也可加大疫苗的计量。
第三针乙肝疫苗在第二针疫苗接种五个月后接种。乙肝疫苗全程接种三针，免疫程序为0、1、6.即当天接种一针，一个月后注射第二针，六个月后注射第三针。第二针与第一针间隔28天以上即可接种，第三针与第二针间隔3个月以上即可接种。在规定的免疫程序最上限时间不超过1个月都可接种，如果超过最上限1个月后接种可能会影响抗体的产生。
乙肝疫苗第2针一般在满月后接种，但是如果孩子有异常情况，比如发热，黄疸，流涕，咳嗽，腹泻等症状时，是不能接种疫苗的，因为会使病情加重，对孩子的身体健康造成损害，此时应该延期，积极治疗疾病，直到病情完全恢复时进行接种。
新生儿接种乙肝疫苗的时间为出生后24小时内接种第一次，然后分别在1月龄、6月龄的时候再次接种，共3次。乙肝疫苗接种同样有一定的禁忌证，如携带乙肝病毒、对疫苗的成分过敏、患有神经系统疾病、重度营养不良、先天性免疫功能缺陷、正在使用免疫抑制剂等人群禁止接种乙肝疫苗。
