治疗精子畸形可以考虑服用药物，改变生活习惯，减少有毒有害物质接触。要调整生活习惯，每天充足的休息，不能熬夜，忌掉抽烟喝酒以及远离辐射环境。平时加强体育锻炼，增强身体免疫力，可以使精子畸形得到改善。
可以考虑半个月内禁欲3到5天，再复查一次精液。如果两次结果都提示少精症，结合女方，考虑进一步的治疗方案。女方正常，可以选择男方药物治疗后自然备孕或者是根据活动精子总数考虑是否人工授精，必要时需要试管婴儿治疗。
禁欲一个月的精子质量不一定会更好。人体的精子在不断的产生，不断的成熟，禁欲一个月很可能体内成熟的精子没有及时排出，会在体内失去应有的活力，体内的精子质量出现衰老的情况发生，不仅不能提高精子的质量，还可能导致精子质量下降，对生育有影响，所以不能靠禁欲提高精子质量。
患者平时建议规律的排精，不要穿过紧的内裤，合理的摄入营养的食物，保持愉快的心情。
如果出现了流产很可能有精液质量差导致，所以应该及时到医院选择精液常规检查，但是对检查的时间还是有要求的，需要禁欲5天左右及时到医院选择精液常规检查，引起男人精子成活率低的原因有很多种如果男人的工作是司机或者是从事计算机行业，建议换一个工作。打算要小孩后男人也要注意休息好，不要熬夜，抽烟，习惯夜生活的男人。
改善精子畸形建议补充蛋白锌、蛋白硒和蛋白质，平时多吃含蛋白锌、蛋白硒和蛋白质高的食物，如牛奶、酸奶等乳类和乳制品；还有豆腐、豆浆等豆制品；和虾皮、海带等水产品。此外，要经常运动、不要久坐。到医院做进一步检查明确引起精子畸形的病因，根据结果在对症治疗。
