脑部核磁共振没有电离辐射，对人体没有放射性的损害。其中脑部核磁共振是利用人体内氢质子，在磁场中产生共振信号来获得的图像。脑部的核磁共振对颅内的检查能够更精确，同时脑部核磁检查不会出现颅骨的伪影，也不需要造影剂，就能够清楚的显示头部冠状位、矢状位等图像。
脑部核磁共振检查没有明确的副作用，因为基本原理是探测人体组织内蕴藏量最丰富的氢离子，在磁共振过程中发出电磁波信号测出氢离子浓度及其驰豫时间，作为成像的参数。
做增强核磁共振，对身体是没有多大影响的。强化需要打针造影剂，造影剂一般很快代谢掉。没有太大危害。而且在做完核磁共振之后，应该是三天之内不要洗澡，尽量保持积极稳定，尽量不要吃辣椒，不要吃容易上火的食物，及时的配合医生进行检查和治疗，及时的进行复查。
费用约在1000元-2000元左右。在临床上头颅磁共振检查主要分为磁共振平扫、脑功能成像以及脑血管成像检查，其中磁共振平扫主要针对既往存在的脑血管病变，以及颅内占位性病变进行检查。
脑部核磁共振不能查脑供血不足，可以通过脑部核磁共振观察颅内血管走形及各级分支，观察血管有无畸形，有无狭窄，闭塞等。脑供血不足，需做个脑血管造影才能明确的。
体内有磁铁类物质者均不能做此检查，要向技术人员说明以下情况，有无手术史，有无任何金属或磁性物质植入体内，不要穿带有金属物质的内衣裤，检查头颈部的病患应在检查头一天洗头，不要搽任何护肤用品；需要除去内衣以外的全部衣服，要向医生提供全部病史资料，以及X线片、CT片。
