通常经干扰素治疗有效者，治疗疗程一般为1-2年；若经干扰素治疗效果不佳者，则需要长期服用抗病毒药物进行治疗，可防止出现肝硬化、肝癌等并发症，对于提高患者生活质量有重要意义。因此，乙肝患者长期进行抗病毒治疗。
乙肝患者是否要做抗病毒治疗需要根据患者的具体病情来看。
如果有乙肝病毒感染的情况，要看具体情况来决定要不要进行抗病毒治疗。如果自身的乙肝病毒dna含量很低，肝功能也完全正常，没有肝硬化、肝癌等症状，肝病病理检查也没有发现明显的炎症，通常是不用进行抗病毒治疗的，注意定期复诊即可。但如果存在肝功能异常的情况，或乙肝病毒dna含量偏高，则要注意是否达到了抗病毒治疗的要求，如果达到了抗病毒治疗的要求，就要进行抗病毒治疗。治疗期间，患者也要定期复查肝功能，以明确自身健康状况。
对于E抗原阳性的患病人，若乙肝DNA的量达到10^5copies/ml同时谷丙转氨酶大于两倍的正常上限的时候，就需要考虑进行抗病毒治疗了。对于E抗原阴性的乙肝感染病人，若乙肝DNA的载量大概在10^4copies/ml，同时谷丙转氨酶达到两倍正常上限也需进行抗病毒治疗。
乙肝抗病毒可以用干扰素注射治疗，干扰素的疗程一般是1年，主要是通过提高免疫力。大三阳的患者，服用到大三阳转成小三阳以后再巩固3年，原则上可以停药。小三阳的患者，乙肝表面抗原转阴1年以后才有停药的可能。
乙肝小三阳患者做抗病毒治疗，需要根据肝功能检查、乙肝病毒DNA检查和B超检查结果来判定，假如乙肝小三阳患者的检查结果是乙肝病毒DNA定量大于10的3次方拷贝/毫升，其谷丙转氨酶水平大于80单位/升时，肝脏发生炎症坏死的程度大于2度等，就是抗病毒治疗的最佳时机。
乙肝病人如果出现肝功能异常、乙肝DNA含量明显增高等情况，应积极进行抗病毒治疗。
肝脏功能一般需要进行后续的动态跟踪检查。不过，有些乙肝病人的乙肝病毒活动比较隐蔽，肝功能正常，但肝有可能出现感染，要进行肝穿刺活检，肝组织学检查显示感染或纤维化级别为2级或更高，则要进行抗菌处理。抗病毒疗法对乙肝的治疗起着至关重要的作用，能够有效地抑制病情的发展。
