注射乙肝疫苗后，人体免疫系统会对疫苗中的蛋白质抗原产生反应，一般在注射疫苗后大约一个月左右就会产生抗体，刚开始抗体水平很低，到了第二针，抗体水平就会迅速上升，很快就能抵抗乙肝病毒感染。接种乙肝疫苗后，从理论分析半个月后会逐渐产生抗体。不过早期抗体的浓度比较低，接种三针结束后，90%以上的患者都会出现保护性抗体。
乙肝疫苗打一针产生抗体定量大于100至少可以持续5年-7年，抗体的水平越高，持续的时间越长，就算抗体水平下降，也能起到很好的保护作用的，因为乙肝的免疫是有记忆的功能的。
打完乙肝疫苗一个月左右会产生抗体。每个人体质不一样，也会因人而异。注射接种程序是半年三针，接种乙肝疫苗前两针主要是产生抗体的作用，后面一针主要是起到加强抗体的作用。
乙肝疫苗在注射第一针后，30%的人产生表面抗体，第二针后50到70%的人产生表面抗体，第三针90%的人产生表面抗体。在全程注射完乙肝疫苗一个月后，应再次检测乙肝表面抗体产生抗体。
每个人接种乙肝疫苗后产生抗体的时间都不一样，乙肝疫苗的接种，需要在六个月内注射三针，正常接种第一针乙肝疫苗以后，就会有约30%的人产生乙肝表面抗体，但是抗体的滴度不高，效果很不稳定，在接种第二针疫苗以后，会有约有90%的人产生抗体，而在接种第三针疫苗后抗体的阳性率可以高达96%以上，而且抗体的滴度很高，免疫效果非常好。就是说接种乙肝疫苗后疫苗产生表面抗体的时间，多数人都在六个月以上。
接种疫苗注射3针后1个月97%的人都可测到表面抗体；乙肝疫苗接种后产生的抗体水平随时间逐渐下降。第2年仍保持在这一水平；第3年降到74%左右，抗体滴度也下降。是否需要再次接种疫苗，主要是要在测定乙肝表面抗体的滴度后，决定何时再打乙肝疫苗。
