如果输卵管是通畅的，这两个操作都不会引起疼痛。如果存在输卵管粘连堵，相对来说通水的疼痛要大一些。因为通水的时候是盲通，医生只能凭借手感和经验来控制通水的压力，难免会有比较大的误差。而输卵管造影可以全程直观看到显影的情况，对于堵塞的部位和程度会比较直接的判断，造成的痛苦会小一些。
输卵管通水的费用大概需要500元，不过根据每位患者的病情程度不同，收费标准也存在偏差。如果是进行的普通输卵管通液，一般在几百元，如果是选择使用Cook导丝通液，费用可能会高一些，大约在几千元，可根据不同的病情采取不同的治疗方法，一般建议在月经干净的3-5天内进行通水检查，同时在检查前三天禁止性生活，术后要注意休息。
常规的输卵管通水大概需要花费千元左右。输卵管通水检查，主要是在B超指示下完成，全部费用总共500-600元左右；另外一种检查是输卵管造影检查，全部费用总共800-1000元左右，包括白带常规化验、血常规检查、心电图检查。还要加其他的检查费，术后一般需要再复查，则需要另外交费。
输卵管通水一般使用生理盐水注入输卵管，以判断输卵管通畅的程度，同时对输卵管不通者起到治疗的作用，如果有阻塞的病人，输卵管通水是不能明确阻塞部位的，在怀疑病人有阻塞时可以做造影发现阻塞的部位，输卵管造影一般使用碘剂注入输卵管，然后通过X线检查，以判断输卵管的通畅程度，一般如怀疑有输卵管不通的，均需要做这两个检查，输卵管造影应该安排在女性月经结束后的3-7天内进行。
输卵管造影是在可视的情况下进行的，能够观察到输卵管通畅状况，并且也可以了解堵塞的部位和堵塞的程度，而输卵管通水却是在盲目的情况下进行，一切完全靠医生的感觉，并且无法判断堵塞状况，输卵管通水现在已经被淘汰了。
输卵管造影检查属于有创性的检查，对女性的身体也是有一定的伤害的。输卵管造影并不会造成程度很大的疼痛，输卵管造影是将造影剂注入子宫和输卵管，在X光机的透视下监视进行。这样就会造成机体吸收一些X线。做输卵管造影也会造成输卵管堵塞的情况，影响受孕。但如果要是想检查输卵管到底通畅不通畅，只能做造影。
