治疗主要是处理结石解除梗阻，解除梗阻后积水可慢慢消失或好转。肾结石的治疗需要根据结石的大小以及患者的情况综合考虑。对于结石小于2cm的可以行体外碎石治疗，碎石效果不明显的可以行输尿管软镜碎石，对于大于2cm的，可以行输尿管软镜或经皮肾镜碎石术。
肾功能衰竭经常会引起脚肿，这个问题的治疗上，作为消肿来说，可以使用利尿剂，如果已经达到尿毒症或者是利尿剂效果不好的，可以选择透析治疗。但是这只是解决表面症状，最重要的还是处理好肾衰，控制好引起肾衰竭的病因，比如糖尿病、狼疮，需要控制好血糖、控制好狼疮活动性，还要处理好并发症，比如控制高血压、纠正贫血等。
可以进行体外冲击波碎石，碎石后结石排出输尿管梗阻恢复通畅，则肾积水即可消失。如果结石巨大，并且是多发结石，呈石街样改变，可以行腹腔镜输尿管切开取石或手术开放切开取石。
只有排出结石肾积水才能好，排石治疗需要根据结石的大小而定。结石6毫米以下，可以用药物、运动、多饮水；结石6毫米以上20毫米以下，可以通过体外冲击波碎石或者腔镜治疗；结石20毫米以上，就得开放手术。
肾功能衰竭是各种因素引起的肾功能损伤，肾小球滤过率小于60%。原因有很多，第一、肾血管疾病，比如肾动脉狭窄、肾动脉硬化。第二、肾实质性疾病，包括各种肾炎，比如膜性肾病、IgA肾病等，也可以是继发性的肾脏疾病，比如糖尿病、尿酸性肾病等。
通常来说，肾结石很小会引起肾积水，具体分析如下：
肾结石是一种非常细小的物质，如果排入输尿管，会造成排尿困难，如果结石滞留在输尿管内，会刺激其下面的肉芽组织，从而造成堵塞。如果结石很小，那么在早期就需要用药物来清除；如果结石滞留较久，且下面还有肉芽组织，只能用手术将其粉碎，再将其排出，可以减轻肾脏的水肿。
