晚上失眠和后脑勺疼有两个主要原因：
1.失眠可能是后脑勺疼痛引起的。后脑勺疼痛的原因包括偏头痛、丛集性头痛、紧张性头痛等。原发性头痛可引起后脑勺疼痛，而继发性头痛的病毒感染可引起神经炎、枕神经痛和颞动脉炎，可导致夜间失眠。
2.频繁失眠会导致头痛，睡眠会导致血管收缩和肌肉收缩，从而导致后脑勺疼痛。
后脑勺痛首先就是检查确定导致头痛的原因，如体温升高要服用解热镇痛药物，缓解疼痛以及降低体温。如果是神经性头痛引起的后脑勺疼痛，保证睡眠质量，并且口服止痛药物。
考虑是跑步运动引起脑部血管痉挛引起的疼痛现象。脑血管痉挛是指颈内动脉或椎基底动脉系统的动脉硬化斑块使血管腔狭窄和出现血流涡流，当涡流加速时，刺激血管壁致血管痉挛。
后脑勺出现疼痛多考虑是神经发炎以后导致的，也有少数可能是因为颈椎病压迫到神经引起，但是也不排除一些脑血管痉挛的可能性，所以具体是哪种原因导致的需要到医院检查一下，然后才能对症治疗。
后脑勺疼可能是枕神经痛，是由于枕大、枕小神经，偶可因耳大神经、颈皮神经或锁骨上神经受损引起，也可由于上段颈椎病、椎管内病变、环枕部先天畸形、脊柱结核、脊髓肿瘤、骨关节炎、转移性肿瘤、上呼吸道感染、扁桃体炎、流感、风湿病和糖尿病等引起。
