如果巧克力囊肿术后卵巢显示不清，有可能是膀胱充盈度欠佳或是肠胀气导致的，如果没有不适，可以先催经等月经干净以后，去医院检查激素6项和在月经的中期检查卵泡的发育情况，看是否能正常排卵。建议平时不要熬夜，养成良好的生活习惯，适当锻炼，增强体质，肥胖，适当减肥，过度肥胖对卵巢功能是有影响的。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症引起。正常的子宫内膜组织出现在盆腔的地方。随着月经周期的变化，异位的子宫内膜会出现出血，引起局部包块。因为包块内容物是褐色的，所以叫巧克力囊肿。子宫内膜异位症主要是可以引起月经的紊乱，引起严重的痛经症状。
巧克力囊肿有很多种临床表现，其因人而异，症状与月经周期密切相关。有25%病人无任何症状。主要症状包括疼痛、盆腔疼痛、盆腔肿块、月经异常、不孕及其他临床症状。因此痛经不是诊断巧克力囊肿的必要症状。另外还有慢性盆腔痛和性交痛。急腹痛常常是由于巧克力囊肿破裂引起的。巧克力囊肿的另一主要症状是月经异常。
巧克力囊肿可在宫腔镜的窥视下看到子宫内膜样组织，由于这种囊肿内潴留的陈旧血瘀如巧克力糊状的颜色，巧克力囊肿的治疗原则是：对有生育要求的年轻妇女一般采用药物治疗并定期随访检查。若症状较重，经药物治疗效果不明显，或卵巢有较大包块的，可以采用保守性手术，如卵巢内膜囊肿巧克力液抽吸术，内膜囊肿剥除术或患侧卵巢切除术，以保留正常卵巢和生育功能。不过，经保守性手术后仍有可能复发。
病史重点询问月经史、孕产史、家族史及手术史。特别注意疼痛或痛经的发生发展与月经和剖宫产、人流术、输卵管通液术等手术的关系。腹腔镜检查主要是在腹腔镜的辅助下对盆腔进行窥视，能够精确的找到子宫内膜异位的位置以及病因，并且对其进行精确的诊断。
彩超检查具体明确囊肿的数值大小以及囊肿对于卵巢的刺激程度选择合适的治疗方案，如果对于卵巢影响不是很大可以选择药物治疗。首先要监测有没有排卵。做个输卵管造影，看看输卵管是否通畅，子宫形态有没有异常，还要排除免疫性不孕。
