生殖道感染；精道部分梗阻；先天性畸形；原发性睾丸功能衰竭；免疫因素，如：自身抗精子抗体等；长期接触有毒化学物质，电离辐射；空气、水质、环境污染及吸烟、酗酒等；长期穿紧身裤及热水坐浴等因素有关。
畸形精子是指精子头、体、尾的形态变异，头部畸形有巨大头、无定形、双头等；体部畸形有体部粗大、折裂、不完整等；尾部畸形有卷尾、双尾、缺尾等。如果有畸形精子情况，还是要先检查清楚自己的问题，解决清楚后，再考虑要孩子的问题。
大豆制品摄入过多会影响男性雄性激素水平，如果每天都食用大豆制品，会让男性的精子数量明显下降，适量吃大豆制品，是避免男性出现健康隐患的方法。所谓“适量”，是指一周吃3次以下，每次100克左右，而不是绝对的不能吃。
精子畸形的类型主要分为三种，一种是头部的畸形，还有就是中部及尾部的畸形。具有临床意义的精子头部异常包括：圆锥形(长宽分别小于5和2微米，或长超过5微米，宽小于3微米)、不规则形、双头和梨形。其中梨形头与牛的不育关系密切，而其对人类生育的影响尚无更多介绍，一般计在不规则形或圆锥形名下，若判断不明确仍按正常计算。
这对自然妊娠有很大影响，因此在妊娠前仍有必要积极调节。可以观察是否存在低前列腺炎症感染。也可以多吃清淡的食物来调节身体，但要避免熬夜等。根据医生的建议积极选择有氧运动等来调节身体。用中药调理。
精子畸形的类型分为头部的畸形，还有就是中部及尾部的畸形。精子头部畸形：具有临床意义的精子头部异常包括：圆锥形、不规则形、双头和梨形；精子中段畸形：如果胞浆小滴大于精子头的一半，意味着精子不成熟，属异常，若小于或等于头的一半应属正常，中段断裂也属异常；精子尾部畸形：常见为断裂、双尾或卷曲，卷曲可能与锌元素含量有关。
