心脏射频消融术由于导管在心腔内操作，仍具有一定风险，但风险较低，严重并发症较少发生。心脏射频消融术较严重并发症为心脏压塞、三度房室传导阻滞以及左心房食管瘘。
该手术具有创伤小，恢复快，成功率高等特点，是一种介入治疗的有效手段。尤其是对于预激综合征、阵发性室上性心动过速、室早搏、特发性室速等有较好疗效。
心脏射频消融术的后遗症有，血管穿刺的并发症，包括局部出血、血肿形成、穿刺部位的感染、气胸、血栓形成、栓塞等。管操作的并发症，包括主动脉瓣返流、心肌穿孔、心包填塞等。放电消融的并发症，包括房室传导阻滞、心肌梗死等。进行心脏射频消融术以后，还是有一定的复发可能。
一般来说，在射频消融术中，如果要进行股静脉穿刺，至少要卧床12个小时以上。
如果是股动脉穿刺，则要在床上躺24个小时，这段时间上肢可以活动，下肢穿刺部位不能活动，下床后一周内不能做剧烈的运动。股静动脉是一条较大的血管，有可能会发生出血和水肿，因此在术后卧床的时候一定要注意，饮食流质食物，避免引起便秘。
心脏早博做了射频消融术后可能会复发。
如果有心脏早搏的情况，在射频消融术后仍有复发的可能。因此，在日常生活中，患者要控制好自己的情绪，保持充足的睡眠，如果出现早搏的情况，可以在医生的建议下服用安慰剂，这样复发的几率会降低，必要时，患者可以就医完善24小时动态心电图。需要注意的是，偶发性早搏可以不用治疗，避免各种诱发因素，定期随访即可。
射频消融是一种通过对炎性病变和病变部位进行治疗的方式，能够加快损伤组织的愈合，从而快速凝结、脱水、止血，从而达到抗炎、缓解疼痛、减少治疗周期的效果。
局部麻醉可以减轻疼痛，但也有一些病人会有器官辐射疼痛。比如胸闷或者是肩部的酸痛。RFA的痛苦与肿瘤的部位有很大关系，如果距离比较近，即使没有注射，也不会感觉到痛苦。如果距离太近，会有剧烈的疼痛。
心脏射频消融术后1-3个月恢复。
射频消融是一种微创的介入治疗。手术后需要卧床。对于有严重的心、肺疾病、肝功能不全、大的肿瘤，在手术切除后，可以适当的延长肝脏的恢复时间。如果是正常的周边器官，在处理时会出现大出血。射频消融后24小时内是否有出血、是否有血尿等情况。术后3-5天，复查肝功能，凝血情况，超声。手术后要服用1-3个月的抗凝药。如果患者无任何不适，手术后即可出院。但要密切关注，看看有没有什么并发症，比如心脏病之类的。