副作用主要有，患者表现为胃肠胀气，可出现肠鸣音或者出现腹泻、腹痛的临床表现。对于易过敏的患者容易出现皮肤红斑、皮疹、荨麻疹等过敏反应。少数患者可出现水肿的现象或者轻度肠梗阻。
不可以长期吃阿卡波糖片，长期服用会产生一些副作用。常有胃肠胀气和肠鸣音，偶有腹泻，极少见有腹痛。如果不控制饮食，则胃肠道副作用可能加重。如果控制饮食后仍有严重不适的症状，应咨询医生以便暂时或长期减小剂量。
阿卡波糖属于糖苷酶抑制剂类的降糖药，可以延缓食物中碳水化合物的吸收，主要作用是控制餐后血糖。中国人饮食习惯中粮食类食物较多，所以容易造成餐后血糖过高。目前研究显示，长期服用阿卡波糖可以明显降低糖尿病心脑血管并发症的发生率。所有降糖药都需要长期服用，并监测血糖，及时调整用药方案。
乙酰氨基葡萄糖苷酶弱阳性不严重，说明有阴道炎，需要白带常规检查，根据白带常规检查结果，阴道内PH值可以确定阴道炎类型和严重程度，在指导下合理使用药物治疗。阴道炎有细菌性、滴虫性和霉菌性，不同的阴道炎用药不同，合理用药，需要注意外阴卫生，不要盲目用药，以免引起阴道内菌群失调。
阿卡波糖可以延缓，减少淀粉等碳水化合物分解成葡萄糖。而人体的肠道只能吸收葡萄糖等单糖，没有分解成葡萄糖时不能吸收，从而起到降低产后血糖的作用。肠道气体增加是阿卡波糖的主要副作用之一，肠道气体增加就会导致放屁多。可以试试用点二甲基硅油或者是乳酶生等药物，减少和消除肠道内的气体。如果用这种方法效果不好，出现难以忍受的肠道气体增加，则要考虑更换药物。
服用阿卡波糖主要的副作用就是胃肠道的刺激作用，引起恶心呕吐，腹泻，腹胀，排气增多等，阿卡波糖的主要作用是通过抑制肠道内对于碳水化合物的吸收而发挥降糖作用。可以在服药的同时进行体育运动和饮食控制。