新生儿接种乙肝疫苗需要在第一天接种第一针，第二针在30天内打第二针，180天打第三针。
现在普遍认为三次乙肝疫苗能够促进人体的免疫，从而降低乙肝病毒的感染几率，降低母亲的垂直传播的危险。不过，接种了乙型肝炎疫苗并不意味着就能得到保护的抗体，而保护性抗体的生成与自身的免疫力有关，因此需要在一周岁左右做一次血液检测，检测到乙肝两对半，以确定是否得到了保护的抗体，如果乙肝表面抗体为阴性则需要进一步接种。
一般情况下，新生儿黄疸通常不能打乙肝疫苗。具体分析如下：
新生儿在出生后的第一个月和六个月内打乙肝疫苗。如果新生儿满月30天，预防接种时会帮新生儿进行黄疸的检测。如果肉眼可见发黄，就不能打乙肝疫苗，需要查明病因。如果出现了轻微的黄疸，需要去医院做检查。新生儿需要在黄疸消失后，肝脏功能恢复，没有其他病理性的黄疸时，方可打乙肝疫苗。
根据实际的情况，乙型肝炎疫苗是非常安全的，一般不会产生不良的反应。
一小部分患者接种完疫苗，会在接种点红肿、硬结，也会有少量的患者会有红肿、硬结等症状，也会有少量的发热症状。乙肝接种后会有明显的过敏性反应，但是通常情况下是没有任何副作用的。副作用很小，属于自限性，需要注意的是要注意的事项。要避免吃辛辣、刺激的食物。
新生儿乙肝疫苗接种后会出现瘙痒、红肿或伴有轻度疼痛、小硬结，这是局部皮肤反应，全身反应，可以出现发热，多数为低热，也有少数出现高热，通常一天内消退。还有的出现疲劳感。
乙肝疫苗第2针一般在满月后接种，但是如果孩子有异常情况，比如发热，黄疸，流涕，咳嗽，腹泻等症状时，是不能接种疫苗的，因为会使病情加重，对孩子的身体健康造成损害，此时应该延期，积极治疗疾病，直到病情完全恢复时进行接种。
打乙肝疫苗后少数人出现接种部位红肿、硬结、疼痛，手臂酸重或发热、恶心、呕吐、乏力、皮疹等与疫苗接种大致相仿的轻微反应，多在1～3天内自行好转。不会影响日常工作和生活。
