增强核磁共振造影剂的危害主要是可能会发生血流动力学改变。有可能会引起碘过敏反应的危险，轻度的过敏反应仅表现为恶心、呕吐等，中度表现为喉头水肿、呼吸困难、荨麻疹等。
脑磁共振可检查血管疾病，如脑缺血，脑梗塞，脑出血，血管畸形等；可检查肿瘤病变，如良性囊肿，垂体瘤，脑膜瘤；恶性，胶质瘤，脑转移瘤等；可检查头外伤，如脑挫裂伤等；可检查鼻窦占位，鼻窦炎症。
造影剂在临床增强检查中是经常使用的，对人体的副作用不是很大，使用之前先做过敏试验，它的副作用是容易引起过敏，所以做检查之前应该消除紧张的心理建议，造影剂是靠肾脏代谢的，所以做完之后，要求多喝水，勤排尿，来把造影剂代谢出去。
脑磁共振可检查脑缺血、脑梗死、脑出血、占位性病变等。导致头痛的原因很多。常见原因，如休息不良或紧张性头痛，也可由高血压、脑血栓形成、脑供血不足、脑血管畸形、急性感染引起的发热性疾病如感冒、肺炎等引起。此外，颈椎病也会导致头颈部疼痛。服用特殊药物和遭受创伤也可能引起头痛。
在接受了冠脉造影后，对比剂会通过肾进行新陈代谢。为了加快排尿速度，病人在进行了股动脉穿刺手术后，常规的输注500~1000毫升的液体，同时适当的加大喝水量，以促进对比物从尿中排出。现在的冠心病介入治疗主要是通过桡动脉穿刺途径进行的，由于对比剂的用量比较小，病人在手术中不需要太多的液体，可以喝1000毫升的温水，2个钟头左右就可以将对比剂排出体外。如果是心脏不全，建议饮用1500毫升以上的水，可以在医生的指导下服用利尿药。
做核磁共振是可以查出来是否有垂体瘤的，脑磁共振对于诊断脑垂体瘤具有非常重要的作用，而且磁共振检查是垂体瘤影像学检查首选的方法。通常通过磁共振检查可以了解肿瘤与海绵窦、脑池、颈内动脉、第三脑室的关系。但是，脑垂体瘤如果合并库欣综合征，有25%-45%的肿瘤在磁共振上不能显示，此刻需要依据症状及相关激素检查予以辅助诊断。
