长期吃恩替卡韦是有副作用的，会出现头痛、疲惫、眩晕、呼吸困难、腹部疼痛、恶心、四肢水肿、身体虚弱、失眠、消化道不良、胃肠道副反应，会出现恶心呕吐，腹痛腹泻等症状，还会导致病人失眠，注意适量服用。
此药可以长期服用，此药是一种核苷类的抗病毒药物，主要是用于治疗慢性乙型病毒性肝炎还有乙型病毒性肝炎引起来的肝硬化。乙型肝炎或者乙型肝炎引起的肝硬化达到抗病毒的标准。
一般赞成在早晨起床的时候，或者是在夜间睡眠的时候，然后在早上起床的时候吃一颗药，然后再隔一到两个小时再吃早餐。或者是晚餐后两小时，或者是睡前吃恩替卡韦。保持空腹的状态吃效果就更好。
如果原本就表面抗原很低，长期的口服恩替卡韦进行抗病毒治疗，转阴的可能性就大一些。如果原本就是大三阳的基础上，恩替卡韦可能要吃很多年，那么短期是不可能转阴的。
吃恩替卡韦并不会得肝癌，如果在疾病早期规范服用恩替卡韦，可以有效地减少乙肝病毒复制，延缓病情进展，是有助于防止肝癌的发生，如果不进行有效的抗病毒治疗，则会导致疾病加重，出现肝硬化乃至形成肝癌。
肝炎患者在服用恩替卡韦的同时，一般需要加用护肝片，对保护肝脏有积极的作用。博路定恩替卡韦片、贝双定恩替卡韦分散片等恩替卡韦一般用于乙型肝炎的治疗，具有抗病毒的作用，可以抑制乙肝病毒的复制与扩散。但该药物的药效比较单一，无法修复被乙肝病毒损害的肝细胞与肝组织，因此加用护肝片对乙肝的治疗具有重要的意义。常用的护肝片如葵花护肝片，是一种中成药，能够发挥稳定肝细胞膜并修复肝细胞损伤、抗肝炎、抗肝纤维化的综合作用，可以很好地弥补恩替卡韦的不足，二药合用，可缩短疗程，并且停药后不易反复。建议患者在医生的指导下联合用药，避免自行用药引起不良反应。
