脑部核磁共振检查没有明确的副作用，因为基本原理是探测人体组织内蕴藏量最丰富的氢离子，在磁共振过程中发出电磁波信号测出氢离子浓度及其驰豫时间，作为成像的参数。
大约2000左右，在一般的三甲综合医院，脑组织的磁共振增强费用包括行磁共振扫描的费用，增强用药的费用以及高压注射器等注射用材料的费用等几部分，脑部的增强脑灌注检查可能也是需要2000多块钱。
外地人在上海孕检流程有要建小卡和大卡。建小卡需要的资料和手续，在女方老家的计生办开出一个流动人口婚育证明。带上婚育证明、双方身份证、户口本、准生证到现在居住地的居委会开一个证明，地上居委会开的证明、双方的身份证、户口本、流动人口婚育证明、准生证去社区的计生办开另外一个证明。带上计生办的证明去社区的医院第一次产检，建立小卡。大卡一般在12-16周的时候建。
费用约在1000元-2000元左右。在临床上头颅磁共振检查主要分为磁共振平扫、脑功能成像以及脑血管成像检查，其中磁共振平扫主要针对既往存在的脑血管病变，以及颅内占位性病变进行检查。
体内有磁铁类物质者均不能做此检查，要向技术人员说明以下情况，有无手术史，有无任何金属或磁性物质植入体内，不要穿带有金属物质的内衣裤，检查头颈部的病患应在检查头一天洗头，不要搽任何护肤用品；需要除去内衣以外的全部衣服，要向医生提供全部病史资料，以及X线片、CT片。
核磁共振检查时间一般在10~30分钟。检查时间和检查部位、检查方式、机器设备有关。头颅、颈椎、腰椎相对比较快，一般10分钟左右就够了，比如颈椎病、腰椎间盘突出等检查比较快。腹部、盆腔相对比较慢，比如怀疑肝脏、肾脏、胰腺、子宫、前列腺等，一般要20分钟左右，如果是增强检查，时间要更长。
