疾病因素：近些年来，由于饮食或不良习惯等原因，使得男性隐私部位患病的几率在不断增加，如隐睾、睾丸炎等，一来会使局部组织出现水肿的情况，二来可能会影响到血管的正常血供，三来会导致阴茎短小，严重的甚至会使生精组织出现坏死的情况，对之后的生育造成一定的影响。
肥胖导致阴茎短的小该需要合理减肥，还可以通过手术进行治疗。1、既然是因为肥胖症，那就一定要瘦，最重要的是，体重减轻了，阴茎附近的肥肉就会消退，露出的阴茎就会变大。2、如果出现了很严重的问题，或者多次的减肥不成功，需要做的是在做手术的时候，因为切除了大量的包皮，也会让阴茎变得比之前长。建议家长根据小孩的具体情况，选择合适的方式来处理。
男孩发育迟缓检查，主要包括体格检查和辅助检查。
评价儿童的各种技能发展是否达到标准，例如大运动，精细运动，语言，社交等。接着进行身高、体重、臀围等身体发展的水平测定；检查儿童的身体状况，包括生化全项、血氨、生长等，比如生长激素、甲状腺功能、血铅等。脑电图、头颅磁共振等都要根据大脑的发展程度和脑电图来判断，最后要结合具体的原因进行基因检测。
肥胖症男孩可能会影响睾丸发育，建议维持在正常的体重。
过度肥胖会影响孩子的内分泌系统，会降低孩子的雄激素，会造成睾丸阴茎等生殖器官的发育不正常，同时还会影响到孩子的生育器官的成熟度。
肥胖会导致儿童体内的脂肪组织增加，导致机体的代谢耗氧量增加，导致儿童发生脑血管疾病，如心绞痛、高血压、冠心病等，因此需要及时控制。
儿童生殖器发育迟缓考虑是包皮过长，但有不少人到了成人时期包皮仍较长，只要经常注意卫生，把包皮翻起进行清洗，不让污垢堆积在里面，就既不会影响健康，也不会影响性功能。
一般情况下，阴茎短小最明显的症状就是阴茎大小没有达到正常范围。建议及时就医，查明病因，对症治疗。具体情况分析如下：
阴茎短小是指在软弱状态下阴茎小于4厘米或在勃起时小于8厘米。阴茎短小属于外生殖器发育不良，主要是由于睾丸组织功能不好，分泌雄激素水平低，导致外生殖器发育迟缓。如果阴茎勃起不超过5厘米，建议做阴茎延长手术。
