长期喝蜂蜜柠檬水的坏处是会刺激胃粘膜，会导致胃痛，不能空腹饮用。糖尿病患者，由于蜂蜜含糖量高，有慢性胃炎的患者，因为蜂蜜和柠檬都会产生大量的胃酸，导致胃不舒服，这两种人不可以喝。
蜂蜜和柠檬一起喝具有杀菌作用，尤其可改善口腔环境，还具有防止血液凝固的作用，可有效预防心脑血管疾病等。蜂蜜柠檬水含有丰富的维生素C和维生素E，有利于增强机体免疫力，可有效预防感冒，还可缓解因感冒所致流鼻涕和咳痰等症状。蜂蜜与柠檬一起泡水喝，有利于促进酒精的分解代谢，而且还具有保护肝脏的作用，可用于缓解因喝酒所致呕吐、头痛等症状。
在经期间不要喝柠檬水，否则会引起腹痛的现象，也因为柠檬水当中的酸性过多，腹痛的人或者是肠胃不适的人尽量不要喝，在喝柠檬水的时候一定要适量，不可过多，否则会刺激胃，在早上不能空腹食用，柠檬水不能长期喝。
百香果柠檬蜂蜜中含有非常丰富的维生c，可以有效的美白皮肤、消除颜面部位的色素沉着，可以起到灭菌杀虫的作用，对于寄生虫性疾病有很好的调节功效，而且可以降低血压、降低血脂，对于心脑血管疾病有治疗作用。
经常喝柠檬蜂蜜水，对身体是有一定的好处的。柠檬中含有丰富的维生素c，具有祛斑的作用。蜂蜜中也含有人体所必需的很多微量元素，比如钙、铁、锌、维生素等等，蜂蜜具有美白润肠通便的作用。
柠檬枸杞蜂蜜是可以一起喝的柠檬具有抗菌、消炎、祛痰的作用，还可以排毒，具有美白养颜、延缓衰老的作用，枸杞主要具有补气养血、清热祛湿等功效，还具有抗氧化的作用，可以养肝护肝；蜂蜜主要具有润肠通便的作用，还可以促进失眠。