乙肝的病毒携带者，如满足了干扰素的抗病毒治疗，应主动应用干扰素进行抗病毒治疗，但也有其不足之处，例如肝硬化失代偿期肝功能不好的患者，以及引起自身免疫有关的病症，例如甲状腺炎，自身免疫性的肝炎等。
干扰素的抗菌疗法有很大的优势，最大的优势就是可以停止使用。对于一些乙肝表面抗原呈阴性，但表面抗原含量偏低的患者，可以通过转阴来完成乙肝表面抗原的转阴，从而使乙肝病毒转阴，这个几率在30%以上，并且在转移后可以停止服用，周期比服用的护肝类的药物要快一些，大约需要一年的时间。
乙肝干扰素通常需要打一年左右，但具体注射时间需要根据具体病情来判断。
乙肝打干扰素的疗程通常要看具体的情况。在注射干扰素的过程中，如果病毒的浓度降低的比较好，表面抗原的含量降低的比较好，一般打一年左右即可。如果一年之后，表面抗原的含量还在不断的降低，那么可以通过延长疗程来促使乙肝表面抗原的转阴，可以延长至72周-96周。但如果使用干扰素不起作用，可以在3个月后停止使用，可以服用核苷类的药物。
打干扰素治疗乙肝一般要一到两个月以后才可以看到病毒量降低。干扰素的作用相对较慢，不是直接的杀灭病毒，而是抑制乙肝病毒；所以需要有个过程。这种药物不是想用就能用的，一定要根据各项检查的结果，结合患者的年龄、性别、病史综合分析，选择恰当的治疗时机，才能达到疗效。
乙肝打干扰素转阴概率是百分之五十，一般是长效干扰素。即在治疗过程中，一般是6个月，表面抗原低于1500IU/ml，这部分病人最终实现临床治愈的比例要明显升高，也就是乙肝能阴转。
干扰素没有确切的时间能好。具体还得需要每月行检查了解肝功能、乙肝病毒、白细胞、血小板、甲状腺功能等检查了解情况。了解后打干扰素，根据恢复的情况，病情决定。长期服用有很大副作用。
打干扰素治乙肝转阴率有30%。可以选择干扰素或者口服药物抗病毒治疗。需要使用抗乙肝病毒药物，由于使用的时间长，目前一般选择口服的抗乙肝病毒药物，干扰素是针剂，使用不方便，而且副作用也相对较大。