可以通过临床症状、辅助检查等方式确诊婴儿肠套叠。
婴儿肠套叠是一种腹部外科疾病，主要的临床表现为腹痛、恶心、呕吐，腹部有腊肠样的包块、出血、果酱样的大便、血便等。临床上，通常会根据孩子的临床症状、体格检查和其他辅助检查来确定。不正常的哭闹、阵发性的异常哭泣、呕吐等，这是肠套叠最常见的早期症状，随着病情的进展，宝宝会出现血便。如果有上述情况需要及时到医院就诊，医生通常会根据孩子的身体状况和辅助检查的结果做出判断，最常用的检查是腹部超声。
婴儿肠套叠，腹痛为早期出现的症状，其特点是平素健康的婴儿，无任何诱因而突然发生剧烈的有规律的阵发性腹痛。表现阵发性哭闹不安、屈腿、面色苍白。每次发作约10～20分钟，以后安静入睡，或玩耍如常，约数十分钟后又突然发作，其症状如前。如此反复多次，患儿精神渐差、疲乏不堪、面色苍白。通过肛门指诊可发现直肠内有黏液血便，可以确诊为婴儿肠套叠。
肠套叠就是将一段肠管套在与身体相通的肠腔中，造成肠内容物透过受阻。
临床上主要分为继发性和原发性两种类型。原发性肠套叠好发于婴幼儿，大多是由于肠蠕动的正常韵律出现障碍而引起。继发性肠套叠则与某些疾病有关，如急性胰腺炎、慢性胆囊炎等均可引起肠套叠。儿童上呼吸道或胃肠道感染等，并发肠系膜淋巴结肿大，可影响肠管正常蠕动，引起肠套叠。
主要还是首先明确引起肠套叠的诱因，比如肠炎、腹泻、高热、季节性添加辅食、受凉、肥胖等，病毒感染等。所以在平时还是要防止各种因素出现。首先应避免腹泻，尤其是秋季腹泻，要注意科学喂养，不要过饥过饱、随意更换食品，添加辅助食品要循序渐进，不要操之过急。要注意保暖，防止受凉。
肚子疼痛的原因有很多种，单纯现在出现腹痛呕吐，并不能确定是否是这一种肠套叠的，平时注意休息，饮食宜清淡，避免辛辣和油腻，避免情绪激动和劳累。必要时可以去医院去进行相关的诊断，进行进一步的确定与治疗。