手指指甲的霉菌感染，目前主要的治疗方式是局部治疗。效果比较明显的是阿莫罗芬搽剂，涂抹前要先将病灶的指甲刮得很薄，涂抹时要注意对周围的肌肤进行保护。如果外用药物没有明显的作用，可以服用特比萘芬，伊曲康唑，氟康唑等抗真菌药物。指甲上的霉菌是一种很难治愈的疾病，需要长期的治疗。另外也要注意自己的身体和公众的健康，尽量不要去碰指甲。
需要口服抗真菌的药物，不过所有的抗真菌药几乎对于身体伤害比较大，尤其对于肝脏。在服用抗真菌药之前，要先体检，尤其肝功，如果身体受不住，那还不如不服药，在服药期间也要监测肝功，如果有什么异常，马上找处方医师。
真菌感染的龟头炎治疗首先就要将包皮龟头清洗干净，保持干燥。因为真菌一般都是在阴暗潮湿的环境下生长，破坏这种生长环境，真菌一般都会慢慢治疗好。也可以在龟头上涂抹抗真菌药膏，一般3到5天就可以治疗好。不主张口服抗真菌的药物，都是以局部用药为主。
药物治疗，可以用一些抗真菌类的药物，也可以局部冲洗，症状明显严重可考虑输液治疗，都具有比较好的效果。针灸疗法，适合脾肾两虚者，可选用脾俞、肾俞、足三里、中极、关元、命门等穴，用补法。
针灸疗法，适合脾肾两虚者，可选用脾俞、肾俞、足三里、中极、关元、命门等穴，用补法；去除易感因素治疗，避免长期使用抗生素或者免疫制剂，血糖控制不佳的糖尿病患者要及时调整血糖，存在梗阻的，要解除梗阻。
一般情况下，脸部真菌感染的治疗方法有以下几方面：
患者可以先口服伊曲康唑胶囊，但需遵医嘱，用药前辅查肝功、血脂等，也可口服盐酸莫西沙星片、复方甘草酸苷片等，再用复方黄柏洗剂、晟露洗剂等冷湿敷贴，也可以用盐酸布替萘芬搽剂、盐酸特比萘芬乳膏等交替早、晚外涂。如感染较重，需预先进行皮肤无菌清创，再用碘化钾溶液、硝酸咪康唑软膏等交替早外涂，平时应忌辛辣、忌饮酒等。