肛瘘是需要进行手术治疗的。肛瘘是直肠粘膜与肛门周围皮肤之间形成的异常通道，但是早期的肛瘘是可以进行药物治疗来进行缓解症状的。术后注意肛门卫生，坚持每天肛门坐浴，定期换药。注意饮食，禁食辛辣刺激性食物，多吃水果和蔬菜。
肛瘘是需要医治，不治是不会自己好的，一般可以通过手术医治，在饮食方面要清淡，主要吃流食和易消化食物、可以多吃青菜和水果，平时还要注意局部卫生，多用清水清洗，还要多注意休息。
肛瘘饮食应以清淡为主，益食用具有润肠通便的食品如新鲜蔬菜和水果，益食用富含优质蛋白质的食物，如牛奶，豆类。可提高机体免疫力，韭菜含有丰富的蛋白质，膳食纤维，氨基酸，维生素以及矿物质，具有润肠通便，补肾壮阳，温中益气等功效。
患有肛门脓肿的一般都可以用多普勒超声检查是否有肛瘘，它是可见的，到三级以上的正规医院做肛肠检查，可以做肛门指检查和肛门内窥镜检查，也可以进行局部彩色多普勒超声和CT检查，找出症状的原因治疗，必要时手术治疗。
一般治疗的时间和严重程度有关的，有的可能在一周到半个月左右的不等，需要定期到医院复查，平时一定要注意个人卫生避免感染，肛瘘的主要原因是肛周脓肿，直肠肛门损伤，肛门裂反复感染等因素导致的。