肛瘘疼痛比较明显，可以口服止疼片，比如曲马多药片，可以有效的缓解疼痛。如果疼痛的特别严重，也可以静脉滴注福比洛芬来止疼，这样止疼效果会比较长。疼痛比较明显的时候也可以肛塞，具有解热镇痛的作用。
肛瘘缓解疼痛的方法是手术治疗。肛瘘是肛管与肛门周围皮肤相通的感染性管道，其内口通常位于齿线部位，外口位于肛周皮肤上。平时要养成正常的膳食习惯，因肛瘘的发生与湿热有关，对于油腻饮食尽量不要吃。
肛瘘多采用挂线法，术后应定期收紧。这主要是为了保持橡皮筋起到慢性割伤的作用会出现疼痛症状。操作一个月后，橡皮筋会基本脱落。然而，如果有些病人肛瘘位置太高，时间可能会更长。
二级疼痛。肛瘘大多采用拔线手术，术后要定期绷紧线，这主要是为了保持橡皮筋的作用，可以起到慢性切割、绷紧线时有疼痛症状，一般一个月后肛瘘手术后要用橡皮筋绷紧线将基本拉紧。
对于肛瘘病人，如果有急性感染，可以给予抗炎药物。同时，排便后应注意保持肛门清洁。肛瘘病人应该及时手术，因为这种疾病无法治疗。建议病人去医院治疗，明确具体诊断，保持排便通畅，以免加重病情。