肛周脓肿排脓之后为什么还有，可能是因为脓肿有两个或两个以上的开口，一个在里面，一个在外面。从外口看，有时可因脓液排出，炎症减轻而暂时性闭合，病人会暂时感到好转了。但实质上内口没有闭合。
不建议自己排脓，可以医院检查一下，手术治疗，在术后以抗炎、止疼药物，饮食要以清淡为主，不可以吃辛辣刺激性食物。肛周脓肿主要是肠道细菌进入肛窦，引起肛腺感染，蔓延至肛周间隙引起的，是会出现肛周持续性剧烈疼痛呈逐渐加重。
一半可以选择肛周脓肿切开引流手术，一般可以在门诊局部麻醉下完成，但是，部分肛周脓肿，由于脓肿位置比较深，需要在住院全身麻醉或者硬膜外麻醉下进行，另外，肛周脓肿除了手术之外，还需要进行抗菌素治疗，以及伤口局部处理。
肛周脓肿可以先切开把脓放出来等有时间了再做治疗。肛周脓肿切开以后就叫肛瘘了，它的病根在肛门里面肛窦的地方。切开放脓只是缓解疼痛了，找到肛窦处的内口才算治好。做肛周脓肿治疗，不需要住院一个多月，脓肿术后十天左右就没什么事了，可以正常上班，伤口完全愈合需要一个月左右。
对于低危的脓肿，肛周脓肿皮下型，在1到2周的时间内能够彻底的治好。而高位的肛周脓肿需要进行挂线疗法，因为内口的位置比较深，之后也需要进行换药，恢复的时间就比较长，大概两周到三周的时间，在治疗期间应该静脉抗炎治疗，增加饮食营养，注意肛周卫生。