得了肛瘘首先需要注意肛门部的清洁卫生，不可抓搔。应经常用温水泡洗肛门，每晚要洗一次，可以用温盐水外洗。还有内裤要勤换、勤洗、暴晒，也可用肛门袋保护肛门，以免过多污染内裤，肛门袋亦要经常换洗，不要让脓液、分泌物积留在伤口部位。
并非要全部手术治疗，早治疗以免发生感染并且严重的时候大便会流出。可以中医保守治疗避免手术。排除脓血和腐肉，合好内口和外口可以恢复好，饮食上多注意不吃辛辣刺激性食物，比如牛羊肉和海鲜，酒要先禁止饮用。
建立正常的膳食习惯，因肛瘘的发生与湿热有关，对于油腻饮食，可以内生湿热，所以不宜多吃，应多吃清淡含丰富维生素的食物，如绿豆，萝卜，冬瓜等新鲜蔬菜，水果，对经久不愈的肛瘘，饮食上多吃含蛋白质类食品，如瘦肉，牛肉，蘑菇等，及时治疗肛窦炎，肛乳头炎，以免发生肛管直肠周围脓肿及肛瘘，肛门灼热不适，肛门下坠者，要及时查清原因，及时治疗。
肛瘘可以热水坐浴、通便、理疗，局部有急性炎症可用抗生素。该疗法只适用于反复发作的脓肿初期以及手术前准备，但不能治好。情况严重的去医院治疗。才可以解决病痛。早日康复。
肛瘘是常见病，临床可表现为肛旁有一硬结，伴反复脓性分泌物，肛门疼痛等症状，治疗宜行手术治疗。术后坚持每日换药治疗，直至伤口完全愈合。恢复时间要根据伤口的情况而定。忌辛辣，忌酒，保持心平气和。清除内口：手术时要找到原发的内口，并把感染的肛窦、肛门腺及其导管切除干净，这是肛瘘治疗的关键。