肛周囊肿是由于感染导致的，进行手术进行脓肿切开引流治疗，手术治疗以后定期清洁换药，不要吃辛辣刺激性过大的食物，不要喝酒。具体恢复的情况根据个人体质不同会有较大的差异，一般需要2周以上的时间。
应该注意伤口清洁卫生，勤消毒换药，饮食宜清淡，忌食辛辣刺激性食物。先不要吃鱼虾牛羊肉，以免上火免疫力下降，肛周脓肿是肛门周围软组织间隙的一种化脓性感染，处理不当容易形成肛瘘，只要有脓液形成，就应该尽早手术切开引流治疗。
手术后一周可以恢复到正常的饮食，但是要注意清淡饮食。可以多吃一些新鲜的蔬菜水果。尤其是可以通大便的一些水果更可以吃，比如香蕉火龙果。油腻辛辣刺激的食品就不要吃。
肛周囊肿没有运动疗法，因为运动治不好肛周囊肿，但是肛周囊肿手术后，头几天还是尽量少运动，多卧床休息。如果说运动对肛门有好处，那比较好的运动就是收缩肛门的运动，叫做提肛运动，这种运动对于卧床，久坐的白领，久站的劳工等都有好处。
肛周脓肿手术后饮食应当注意以容易消化的食物为主，包括流质或者半流质饮食，比如稀饭、粥、汤，保持大便排出通畅。同时，应该注意营养均衡，以促进伤口愈合，可以摄入蛋、鱼及肉类和蔬果。此外，要注意避免辛辣刺激、烟熏油炸食物，远离烟酒，注意休息，以免影响伤口愈合。
肛周囊肿手术之后没有完全治好或者是手术出现了失败是有可能出现肛瘘，但是这种现象发生的几率不是非常大，术后需要养成定时排便的习惯，避免大便干燥。饮食宜清淡，容易消化，少渣滓，以免排粪次数增多。有习惯性便秘或排粪不畅的病人，平时要多食含纤维素多的蔬菜，水果，保持粪便柔软，排便时不要太用力或蹲厕过久。