肛痿的原因多为一般性化脓感染，少数为结核性，克罗恩病、溃疡性结肠炎、恶性肿瘤、肛管外伤等也可形成肛瘘。大多数肛痿起自肛管直肠周围脓肿，当脓肿自行破溃或切开引流处成为外口；脓肿缩小，形成感染性管道，其原发病灶成为感染源不断进入管道内口，因此经久不愈。外口皮肤生长较快，常常假性愈合，以致又破溃，反复发作。
一般可能是痔疮引起的，痔疮主要是看轻重的程度，一定要调整饮食生活规律，多食用富含纤维的食物。多吃蔬菜水果谷类。还可以促进肠蠕动利于排便。不要吃辛辣油腻的东西，酒咖啡也尽量少喝。
如果在孩子很小的时候没有养成良好的排便习惯，那么是会引起肛瘘疾病，新生儿大便应该是稀释的才对，不应该存在干燥的现象。如果一出生就开始有干燥大便，那么在便秘过后就要考虑给孩子做检查了，当知道孩子肛瘘之后就要及时地治疗，而孩子肛瘘的形成原因还有可能是由于肛门周围遭受到了严重的感染所导致的。
肛门周围脓肿：主要因污染粪便滞留肛隐窝，引起肛腺炎，导致肛门周围脓肿，是肛瘘形成的主要原因。直肠肛门损伤：外伤、来自消化道的骨性异物、金属、肛表及肛门窥器检查损伤肛管直肠，细菌侵入伤口即可引起肛门周围脓肿。肛裂：肛裂反复感染，可引起皮下瘘，也可引起肛腺炎。
由于久坐，便秘，肛周不洁，进食油腻肥厚辛辣导致的。需要增加纤维性食物，改变不良的大便习惯，保持大便通畅，防治便秘和腹泻。热水坐浴可改善局部血液循环。肛管内注人油剂或栓剂，有润滑和收敛作用，可减轻局部的疹痒不适症状。
肛瘘通常是由肛周脓肿引起的，与生产无关，考虑是产前的，产后症状，如脓毒和瘙痒发生由于虚弱和局部感染，如果症状轻微，是可以洗掉的，可以进行手术，如果出现严重脓肿，建议手术治疗，如果在肛周脓肿期进行手术，就不会形成肛瘘了。