儿童生殖器疱疹可以挂皮肤科或者泌尿外科。去医院完善检查，明确诊断，在医生的指导下选择治疗方案。可以每天用清水清洗生殖器部位。当出现局部的感染后，要及时用消毒水清洗局部，避免局部的搔抓，不可用刺激性太强的药品。
生殖器局部，一般在皮肤和粘膜交界处，出现红斑，随着病情发展出现水泡，继而水泡破裂形成浅糜烂或者是溃疡。也有部分免疫力低下的还会出现前驱症状，在疱疹出现的前1-2天，局部就会出现刺痛、烧灼或者瘙痒等症状。
治疗生殖器疱疹，目前有很多方法，传统疗法很多，药物、激光、冷冻、电灼、手术等，但这些治疗方法只能暂时控制症状，很难根除，造成生殖器疱疹反复发作。但是现在有很多科学的方法，尽早去治疗的话是可以完全好的。所以治疗的时候一定要选择正规的专科医院，单纯的吃药是好不了的。
生殖器疱疹是会导致腰疼的。无论是吃药、输液、手术、冷冻、还是激光治疗等，对生殖器疱疹缓解临床症状和抑制病情确实起到了一定作用，有的经过治疗疱疹也消失了，表面看起来好像是治好了。但都忽视了深层次清除病毒、重建机体免疫、杜绝生殖器疱疹复发重要环节，生殖器疱疹的复发不可避免。
病毒培养自水泡底取标本，女性还可从宫颈部位取材，作组织培养分离病毒，此法敏感，结果特异，为诊断的金标准。但此法所需技术条件高，从接种到做出鉴定所需时间为3～5天。培养的阳性率为60%～90%。因此培养阴性不能除外生殖器疱疹。