生殖器疱疹一定要重视疾病的早期治疗，这种疾病在初期时候病情比较轻，只要采用正确疗法治疗，就能取得很好疗效，不会发展到很严重的程度，要是错过治疗时机就会增加并发症的发生几率。应该趁着比较轻的时候及时治疗，早确诊早治疗效果更好，不会造成更多危害和影响，平时应该注意休息，不能过度劳累，患病期间要禁止性生活，要是之前出现了性生活，就有必要带着性伴侣一起检查和治疗，防止交叉感染的情况出现很重要。
抗病毒药治疗：具体用量及疗程以个人情为准，频发复发者则需以较低的剂量服用较长时间的疗程。一般疗法：主要是保持局部清洁、干燥。可每天用生理盐水清洗，疼痛者可口服止痛药。
得了生殖器疱疹后要杜绝不良性生活，同时性伴侣也要同时治疗，避免交叉染。最主要还是注射增强免疫力的针剂，同时加强锻炼身体。治疗一般要保持疱疹壁完整，清洁与干燥，防止继发。
妊娠合并生殖器疱疹的治疗方法一般有局部用药、全身用药等，具体内容如下：
1.通过局部用药可以保护疱疹的粘膜，使用生理盐水清洗阴道，使其干净、乾净。用甲紫溶液或阿昔洛韦乳膏或乳霜涂抹于病变部位，或使用酞丁安软膏。如果有明显的痛楚，可以在局部应用盐酸利多卡因软膏或口服镇痛药物，也可以将奥平的栓剂放入阴道。
2.全身用药一般建议口服阿昔韦，反复发作者应长期口服。怀孕期间要按照医生的指示服用。阿昔洛韦治出现任何其它不良反应，通常只是暂时降低嗜血因子引起的。
生殖器疱疹是一种传染性极强，复发率极高，临床难治的性传播疾病，虽然是一种顽疾，但并非不治之症。治疗难点在于彻底杀毒，不留后遗症。西药起效比较快，可缓解或改善生殖器疱疹的不适症状。对重度的生殖器疱疹，尤其是反复发作、久治不愈的症状，光吃这些药基本无用。目前通过单纯性服用中药治疗生殖器疱疹较少见，通常仅用于辅助治疗，诸如一些清热解毒的中成药或草药，对临床不适症状的缓解有一定帮助。
一般药物很难抑制，生殖器疱疹的复发率很高，西医叫不治之症。中医中药长期临床实践积累了很多独特的治疗方法，主要是要把体内的HSV病毒完全清除掉才行，要不能几个月以后又会导致复发。