长期不吃主食的危害会诱发各种疾病。主食摄入量太少，处于半饥饿状态，容易出现反应性高血糖，引起低血糖抗病能力下降引起糖尿病。高脂血症、高血压、冠心病也会接踵而至。
仅靠不吃主食来减肥，会对身体的健康造成不利的影响。因为主食是碳水化合物的主要来源，是人体不可缺少的营养成分，人体缺少碳水化合物，会造成身体的激素不能正常的分泌，从而导致身体衰老。所以说减肥可以少量的吃主食，但不能不吃主食。减肥期间可以控制饮食和调节饮食，吃一些新鲜的蔬菜水果，再结合运动锻炼身体，如跑步、游泳、瑜伽等有氧运动，在增强体质的同时还能够加速脂肪燃烧，对减肥瘦身有很大的好处。
导致高脂血症，容易引起各种心脑血管疾病。长期不吃主食，还可能导致胆结石和胰腺疾病。不吃主食经常会感觉肚子饿，如果没有及时的摄取其他健康的食物，身体为了取得能量会动用自身的腺体去燃烧组织，这样很可能得上胆结石。
糖尿病患者一般不是一定要少吃或者不吃主食。
对于患者来说，碳水化合物的摄入量应该是每天总热量的50%-55%左右，另外，平时吃的含碳水化合物比较多的食物，也应该算在主食中，比如山药和南瓜，这些食物主要是提供碳水化合物、蛋白质、膳食纤维、B族维生素等，都是传统食物的主要来源。日常饮食要注意营养均衡，不要暴饮暴食。
身体不适时建议及时前往医院，在医生指导下接受治疗。
肛瘘的患者主食要以馒头米饭为主，注意多食用含有高脂肪的食物，比如肥肉等，起到润滑肠道帮助排便的作用，另外还要吃高蛋白的饮食，比如牛肉，鸡蛋，豆腐，促进手术创面的生长。
不吃主食只吃菜是可以减肥的。但长时间会对身体的健康不利。人体变胖是由于蛋白质、糖和脂肪的转化造成的，如果平时少吃蛋白质、含糖量过高的主食，确实可以减少脂肪的摄入，但由于人的体质不同，只吃菜不吃主食，容易造成营养失衡，诱发低血糖和营养不良。