高位复杂性肛瘘是肛瘘里最复杂的一种，这种肛瘘内口的位置比较高，瘘道的走形比较弯曲，经常会伴发两个或者两个以上的内口，还有的会形成马蹄状的肛瘘，所以是比较复杂的一种疾病，需要手术治疗。
肛周脓肿手术后恢复，发生高位复杂性肛瘘需要及时去医院进行进一步的检查和针对性的治疗。可以通过手术的方法进行治疗，治疗之后一定要按实际情况要注意保持创面引流的通畅，防止复发。
肛瘘需要到医院肛肠科进行系统的检查，必要时进行手术治疗。出现流脓的症状要及时治疗，避免症状加重甚至出现大便失禁的风险。注意饮食和生活习惯，忌辛辣，多吃水果蔬菜，保持大便通畅，不熬夜。
复杂性肛瘘加内痔采取抗炎药物，凉血止血等药物治疗，同时注意饮食，避免着凉，只能够缓解症状，不能彻底解决问题，容易反复发作。及时到正规公立医院肛肠科就诊，由专科医生根据实际病情采取手术治疗，效果是比较好的。
应选手术治疗，内口的存在，脓肿虽然破溃或已切开引流，但原发感染源如肛窦炎、或肛腺感染依然存在，肠腔内容物还可从内口继续进入瘘管；肛门部不能静养，脓腔不易粘合：排粪、排尿时，因括约肌收缩或因炎症刺激肛门括约肌，使肛门括约肌经常处于痉挛状态。