肛瘘与痔疮都是肛肠科常见的疾病，二者临床症状有相似之处，但二者有本质区别的。肛瘘是指发生在肛门直肠周围的脓肿溃破或切口引流的后遗病变。而痔疮主要是指直肠下段黏膜下和肛管皮肤下的静脉丛淤血、扩张和屈曲所形成的静脉团。
肛瘘和痔疮是两个完全不同的常见肛门病。肛瘘基本都是肛腺感染引起，是由肛周脓肿破溃后缓慢发展而来。肛瘘最主要的症状就是肛周疼痛不适和肛周出现脓血性分泌物，确诊后就必须及时手术治疗，避免病情由低位单纯肛瘘发展为高位复杂肛瘘。痔疮基本都是肛垫下移和静脉曲张引起，分为内痔和外痔。最为常见的症状就是便鲜血、血便后肛门肿物脱出，肛门潮湿、瘙痒和肛门疼痛不适。
痔疮是慢性疾病，肛瘘是急性外科疾病。痔疮一般不会引起人的不舒服，如果长期坐卧，吃辛辣油腻刺激性食物，容易出现痔疮发作，改善饮食，少吃油腻辛辣的食物，多吃蔬菜水果就可避免。肛瘘是因为肛周脓肿或者严重感染形成的一个急性外科疾病，也要少吃辛辣刺激性食物，要及时治疗。
流脓是主要症状，脓液多少与瘘管长短，多少有关，新生瘘管流脓较多，分泌物刺激皮肤而瘙痒不适，当外口阻塞或假性愈合，瘘管内脓液积存，局部肿胀疼痛，甚至发热，以后封闭的瘘口破溃，症状方始消失.当地三甲医院或三甲以上的医院检查治疗，肛瘘不能自愈。不治疗会反复发作直肠肛管周围脓肿．因此必须手术治疗。治疗原则是将瘘管切开，形成敞开的创面．促使愈合。
肛瘘和痔疮是两种完全不同的疾病。肛瘘是感染后形成的窦道，表现为肛周肿物反复破溃流脓，迁延不愈，是肛窦感染所致。由内口，外口，漏管组成。而痔疮不是感染导致的，和饮食生活习惯密切相关。临床表现为大便带血，色鲜红，肛缘肿物疼痛，便时肛内肿物脱出。
肛瘘由肛周脓肿引起，临床表现为局部红肿、疼痛、破溃、流脓，反复发作；痔疮由肛门周围肿物脱出引起，临床表现为肛垫病理性增生肥大，引起脱出、出血以及肛门的坠胀、瘙痒等不适。