肛瘘手术以后，如果没有任何其他的特殊症状，是可以适当下来活动了，平常要注意局部的卫生，要加强换药，同时要注意加强营养物质，要养成每天排便一次的习惯，避免出现便秘。
肛瘘手术后要注意饮食宜清淡，少食辛辣、煎炒、油炸、烈酒等不消化和刺激性食物，多食水果、蔬菜和纤维性食物，多饮水，尤其是香蕉、苹果，蜂蜜类润肠通便食物，一个月就可以恢复了。
肛瘘术后的恢复情况因人而异，肛瘘术后需要1~2个月之后才能痊愈，因为肛门部位每天都会有大便排出，每排出一次大便对肛瘘术后伤口都有损伤刺激，所以恢复的特别慢。
肛周脓肿切开引流后，最短也要半年的时间才可能形成肛瘘。MRI确定脓肿部位及内口位置一次性挂线引流，治疗肛肠直管周围脓肿，能取得较好的临床效果。如果一期手术治疗效果不佳，可以采用二次的肛瘘手术治疗。
肛瘘手术后，如果没有继发细菌感染，正常生理功能可在半个月至一个月左右完全恢复。手术后，应多吃苹果、香蕉、绿豆牙、冬瓜、黄瓜、苦瓜、芹菜、菠菜、韭菜等粗纤维食品，以促进胃肠蠕动，保持排便通畅。