大多数肛周脓肿起源于肛腺导管的阻塞伴细菌繁殖和脓肿形成，缺乏波动感时应延迟引流。治疗应包括脓肿的切开引流和防止切口假愈合而导致急性复发。切口宜适当，置管引流或挂线。肛瘘术前常用挂线控制局部感染。很多肛周脓肿在门诊容易治疗，但复杂性感染需在麻醉下检查以确保适当引流。
用干净的棉花或软布将水吸干，不要擦肛门，这样就能大大减少外翻直肠粘膜的损伤，达到预防肛瘘的目的。一旦发生肛瘘则应及时去医院采用外科手术或挂线疗法治疗，绝大多数病人在短期内就可治疗。
肛周脓肿治疗一定要选择到正规的医院接受治疗。由于多数肛周脓肿是需要手术切开引流的，要注意一些肛周脓肿的治疗禁忌。微创肛周脓肿手术是借助先进的探针配合双氧水灌注的方法，准确找到全部内口，有效避免漏诊、漏治。平常要吃含纤维素多的食品，尽量的少吃辛辣刺激性的食物。
那么也是属于常见的肛周疾病，而且比较痛苦，建议及时到肛肠科就诊，必要时需要切开引流的，同时需要抗感染治疗。很多痔疮的病人是可以出现肛周脓肿的，所以是建议根据自身的情况进行痔疮原发病的治疗。肛周脓肿是肛肠科的急重症，需及时治疗，只有很少数肛周脓肿用抗生素类药物治疗，热水坐浴及局部理疗等可以消散，但大多数都需要手术治疗。
加强锻炼：能够增强机体的抗病能力，减少疾病发生的可能，对于其他疾病也有一定的预防作用。这是因为体育锻炼有益于血液循环，可以调和人体气血，促进胃肠蠕动，改善盆腔充血，防止大便秘结，注意饮食调节：不喝酒，不吃辛辣刺激的食物。