肛瘘是肛肠科的常见疾病的，唯一有效的方法就是手术的，除此之外没还有保守疗法的，但是保守治疗一般只能减轻症状和减少发作。可以选择微创无痛手术的，痛苦小，一般不用住院的。调理排便：保持大便通畅，防止腹泻或便秘，以减少粪便对肛瘘内口的刺激。清洁肛门要勤换内裤。
肛瘘不开刀治疗的方法主要是选择使用药物以及用药物进行肛门坐浴，比如使用消炎药以及中药等药物调理，促进肛瘘瘘管内的脓液排出，消除炎症，同时配合肛门洗剂或者复方苦参洗剂进行坐浴，可以清洁肛周皮肤，避免感染加重。再配合冷冻、激光、电疗的方法进行瘘管的根除，或者选择药物进行瘘管的填塞，闭合内口。
肛瘘有很多治疗方法。常用的是传统药物疗法，传统手术方法和微创疗法。肛瘘由内外口和瘘管组成。如果肛瘘严重，可能有多个瘘管和瘘管。如果传统疗法不能发现准内，完全消除原有感染，或瘘管未完全切除，很容易复发，这是传统手术的一大缺点，肛瘘想要彻底治疗，还需要微创手术肛瘘治疗方法比较好。
肛瘘发现即可采用手术治疗，效果较好，以免加重病情。日常要注意调节饮食，吃些清淡易消化的，蔬菜水果，尽量不抽烟喝酒咖啡辛辣刺激食品，另外尽量不要长久站立，不利于血液循环。
最有效的治疗方法是进行手术，具体的分型，对于单纯性的浅表性的肛瘘，可以行切除缝合，比较深的复杂性的肛瘘，需要进行挂线疗法，手术以后需要定期进行换药。严重时需要及时就医。