对于复杂性的肛瘘，通常选择挂线疗法。目的是起到局部的慢性切割作用，避免术后的复发。肛瘘从病理学的角度讲，是肛周脓肿的慢性期的一种表现，若肛门直肠脓肿在早期能够处理得当，往往可使脓肿消散治疗效果显著，不遗留后遗症;如延误早期的治疗时机或处理不当，组织坏死脓液可顺其局部间隙扩散，使病情加重复杂化。
有内、外口的低位单纯性肛瘘、高位单纯性肛瘘或作为复杂性肛瘘切开、复杂肛瘘切除术的辅助治疗。挂线疗法是复杂性肛瘘手术中最常用、最普遍的方法。挂线是利用橡皮筋或有腐蚀作用的药线的机械性压迫作用，缓慢切开肛瘘的方法。挂线既可松驰挂线作标志和促进纤维化作用，达到短期和长期引流的治疗目的。也可以逐步紧线以达到缓慢切割括约肌的目的。而药线的作用主要是抗菌，抗炎和促进肛瘘的愈合。
利用丝线或橡皮筋紧缚，以机械压力或收缩力，钝性缓慢剖开管道，用以治疗肛瘘的一种方法，该疗法简便、经济、不影响肛门功能，具有瘢痕小，引流畅通等优点。麻醉方式采取腰骶麻醉、局部麻醉或全麻。适用于瘘管超过肛直环的高位肛瘘，临床上能明显触及索条状的管壁，无分支。
肛瘘挂线疗法指的是利用橡皮筋等的机械性压迫作用，缓慢切开肛瘘的一种手术方式。此方式最大的优点在于不会造成肛门失禁，且可以有效的引流瘘管。此手术方式操作简单，出血少，无需术后换药。
肛瘘挂线疗法需要2-4周左右才可以脱落。定期进行坐浴治疗，是每天两次，每次大于半个小时，做好伤口护理、换药处理。饮食方面上，避免刺激性饮食，禁忌烟酒，还有保持大便通畅。另外，还要定期紧线。多休息。