原发性胆汁性肝硬化应做的检查，血常规，尿常规正常，有黄疸的时候可出现胆红素、尿胆原增加。影像学检查X线检查、腹部超声检查、CT/MRI。内镜检查可确定有无食管胃底静脉曲张。肝穿刺活检九、腹腔镜检查，腹水检查，门静脉压力测定。
胆汁性肝硬化需要检查有血常规，尿常规，粪常规，肝功能检查，血清免疫学检查，影像学检查X线检查、腹部超声检查、CT/MRI，内镜检查可确定有无食管胃底静脉曲张，肝穿刺活，腹腔镜检查，腹水检查以及门静脉压力测定。
胆汁性肝硬化要做实验室检查，胆道造影：可用静脉法、经皮经肝胆管造影或内镜逆行胆管造影法，以除外肝外胆道梗阻；肝穿刺活检：活体病理检查，有确诊价值，但如胆汁淤积严重，或有出血倾向应慎重考虑，必要时行剖腹探查并活检。
早期肝硬化典型是症状不明显，易于其他疾病相混淆或不易被发现，对治疗和预后都是不利的，因此要想及早发现肝硬化，需定期检查，那发现早期肝硬化可做肝脏影像学检查：肝脏B超能对肝实质、肝动脉、肝静脉、门静脉、脾脏及其他脏器进行多方位、多角度检测，对肝硬变和门脉高压症具有较高诊断价值。
要进行肝功能检查，血清胆酸浓度增加药物原时间延长早期注入维生素K后可恢复正常，晚期肝功能衰竭时则不能矫正血清白蛋白在疾病早中期正常晚期则减少血胆红素增高，直接胆红素为主尿胆红素阳性由于胆红素从胆汁中排出减少粪胆原及尿胆原均减少。
检查项目：血脂检查、结合胆红素（SDB、DBIL）、肝纤维化四项、抗组蛋白抗体、抗线粒体抗体、抗乙酰胆碱受体抗体、尿胆红素（BIL）。实验室检查，血脂、血清胆酸、结合胆红素、AKP、GGT明显升高，转固氮酶正常或轻度或中度升高。抗线粒体抗体阳性，IgM升高。尿胆红素阳性，尿胆红素正常或下降。采用影像学、超声、ERCP、CT、PTC等方法观察肝内外胆管扩张及肝外梗阻性黄疸。