乙肝大三阳与小三阳之间存在差异，大三阳表明病毒复制较活跃，传染性相对较强。
小三阳一般提示病情处于慢性化，传染性较弱。当然，对乙肝患者来说，也以大三阳或小三阳为准，及乙肝DNA和其他有关数值，对疾病进行全面的分析和判断，及抗病毒治疗方案的指导。临床上主要使用的是拉米夫定联合利巴韦林进行抗病毒治疗。当前乙肝患者在接受了正规抗病毒治疗后，病情很平稳，而抗病毒治疗则需长期服药，现在口服药物治疗时间至少为4年，部分病人需终身服药。
乙肝大三阳转小三阳的患者有很多，中国大约9千万的HBV感染者，而慢性HBV患者约2千万，而HBV患者约7000万，肝功能正常的大三阳患者约为7000万，而肝功能正常的小三阳患者则更多，而这些肝功能正常的乙肝小三阳患者，则是自发性转阴。一般来说，30岁之前，大部分人都可以从大三阳转为小三阳，但是30岁之后，如果还做不到，就会有肝炎、肝纤维化、肝肿瘤等并发症，需要根据具体的情况进行分析，大三阳患者在服用干扰素的时候，如果有干扰素的适应症，那么就有可能转化为小三阳。
大三阳变为小三阳，多是由于乙型肝炎患者体内的病毒被基本清除，或是基本达到了自愈效果，不会再有肝炎活动，如果乙肝患者在25～30岁前完成了这个过程，那么以后多不会再发生肝硬化、肝癌。当然变异株感染者除外。
大三阳是：乙肝表面抗原、乙肝E抗原、乙肝核心抗体阳性。称为大三阳。小三阳是：乙肝表面抗原、乙肝E抗体、乙肝核心抗体阳性。称为小三阳。大三阳的传染性强，小三阳的传染性弱。大三阳也是会发展为小三阳的，但是未必都是转变为好的意思，所以需要综合其它临床的检查结果来分析病情，生活上注意戒烟戒酒，饮食清淡，以蔬菜水果为主，少吃辛辣食。
乙肝大三阳和小三阳都是针对乙肝五项来说的，乙肝五项包括乙肝表面抗原、乙肝表面抗体、乙肝e抗原、乙肝e抗体和乙肝核心抗体五项。大三阳是指以上顺序中的第135项阳性，小三阳指第145项是阳性的。常规的大三阳提示病毒复制活跃，而小三阳提示乙肝病毒处于相对稳定的状态，但是并不能一概而论，有的乙肝五项呈现的小三阳。
在乙肝两对半化验单中，乙肝小三阳是145阳性，乙肝大三阳是135阳性。乙肝大三阳提示乙肝病毒数量多，病毒复制活跃，传染性大。乙肝小三阳提示乙肝病毒数量相对较少，病毒复制活跃称程度低，传染性小。所以乙肝大三阳比乙肝小三阳要严重些。但是针对乙肝大三阳患者也不要担心，目前有恩替卡韦、替诺福韦酯等抗病毒药物，90%能使大三阳转变为小三阳的。