副作用主要反应在服用的疗程和剂量有关。比较常见的不良反应包括电解质的紊乱，尤其是低钾血症的出现，其次，由于氢氯噻嗪还可以抑制胰岛素的释放，干扰肾小管排泄尿酸，所以长期服用还会出现高糖血症和高尿酸血症。其他少见的不良反应包括过敏，血细胞下降，以及胆囊炎，胰腺炎，性功能减退等。
氢氯噻嗪是在临床上应用比较广泛的一类药品，其大多数不良反应主要与服用的疗程和剂量有关。比较常见的不良反应包括电解质的紊乱，尤其是低钾血症的出现，主要与噻嗪类药品的排钾作用有关。其次，由于氢氯噻嗪还可以抑制胰岛素的释放，干扰肾小管排泄尿酸，所以长期服用还会出现高糖血症和高尿酸血症。其他少见的不良反应包括过敏，血细胞下降，以及胆囊炎，胰腺炎，性功能减退等。
这个药物引起副作用常见的就是出现一些中枢神经系统的一些症状，出现头晕头疼乏力，还有抑郁的症状。或者上呼吸道的症状，比如可以出现咳嗽，鼻炎，鼻窦炎，还有咽炎，偶见还有一些胃肠道反应，比如出现恶心，腹痛，腹泻，还有消化不良。
会有一定的副作用，用药期间有可能出现咳嗽、咽炎、恶心、腹泻、消化不良、腹痛等症状，少数病人也可能会有皮肤瘙痒、过敏反应。如果没有明显的不良反应，不建议长期服用，长期服用有可能导致缺钾。
氢氯噻嗪片又叫双氢克尿噻，副作用和不良反应可以表现为水、电解质紊乱，出现口干、烦渴、恶心、呕吐以及极度疲乏无力。检测血的指标可以出现低钾血症、低氯血症、低钠血症等，临床表现是异位心律或者快速性的心律失常。另外还可以导致糖耐量异常而出现血糖升高、尿糖升高等，还可以干扰肾小管的排泄尿酸导致血尿酸升高，甚至诱发痛风。
这种药物长期服会影响重要脏器如心、脑、肾的功能，最终可导致这些器官的功能衰竭。比如头痛、眩晕。偶见乏力、抑郁。咳嗽、鼻炎、鼻窦炎、咽炎、上呼吸道感染、鼻出血。恶心、腹泻、消化不良、腹痛。